ਅਲਜ਼ਾਈਮਰ ਰੋਗ (AD) ਵਿੱਚ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਘਾਟ ਹੁੰਦੀ ਹੈ ਜੋ ਇਸਦੇ ਮਲਟੀਪਲ ਅੰਡਰਲਾਈੰਗ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਨਿਦਾਨ ਅਤੇ ਇਲਾਜ ਦੀ ਪ੍ਰਗਤੀ ਵਿੱਚ ਰੁਕਾਵਟ ਪਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਇੱਥੇ, ਅਸੀਂ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ (CSF) ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਲਈ ਵਿਆਪਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਜੋ AD ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਦੀ ਇੱਕ ਵਿਸ਼ਾਲ ਸ਼੍ਰੇਣੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਮਲਟੀਪਲੈਕਸ ਮਾਸ ਸਪੈਕਟ੍ਰੋਮੈਟਰੀ ਨੇ AD CSF ਅਤੇ ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਕ੍ਰਮਵਾਰ ਲਗਭਗ 3,500 ਅਤੇ ਲਗਭਗ 12,000 ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ। ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਨੈਟਵਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ 44 ਜੈਵ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਮੋਡੀਊਲ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕੀਤਾ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਵਿੱਚੋਂ 15 ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਨਾਲ ਓਵਰਲੈਪ ਕੀਤੇ ਗਏ। ਇਹਨਾਂ ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਮੋਡੀਊਲਾਂ ਵਿੱਚ CSF AD ਮਾਰਕਰ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀਕਲ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹੋਏ, ਪੰਜ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਜੋੜਦੇ ਹਨ। AD ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਸਿਨੇਪਸ ਅਤੇ ਮੈਟਾਬੋਲਾਈਟਸ ਘਟਦੇ ਹਨ, ਪਰ ਸੀਐਸਐਫ ਵਧਦਾ ਹੈ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਸੀਐਸਐਫ ਵਿੱਚ ਗਲਾਈਲ-ਅਮੀਰ ਮਾਈਲਿਨੇਸ਼ਨ ਅਤੇ ਇਮਿਊਨ ਗਰੁੱਪ ਵਧਦੇ ਹਨ। ਪੈਨਲ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੀ ਇਕਸਾਰਤਾ ਅਤੇ ਰੋਗ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਦੀ ਪੁਸ਼ਟੀ 500 ਤੋਂ ਵੱਧ ਵਾਧੂ CSF ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ। ਇਹਨਾਂ ਸਮੂਹਾਂ ਨੇ ਐਸੀਪਟੋਮੈਟਿਕ AD ਵਿੱਚ ਜੈਵਿਕ ਉਪ ਸਮੂਹਾਂ ਦੀ ਵੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਨਤੀਜੇ AD ਵਿੱਚ ਕਲੀਨਿਕਲ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਲਈ ਵੈੱਬ-ਅਧਾਰਿਤ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੂਲਸ ਵੱਲ ਇੱਕ ਸ਼ਾਨਦਾਰ ਕਦਮ ਹਨ।
ਅਲਜ਼ਾਈਮਰ ਰੋਗ (AD) ਦੁਨੀਆ ਭਰ ਵਿੱਚ ਨਿਊਰੋਡੀਜਨਰੇਟਿਵ ਡਿਮੇਨਸ਼ੀਆ ਦਾ ਸਭ ਤੋਂ ਆਮ ਕਾਰਨ ਹੈ ਅਤੇ ਇਹ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਣਾਲੀ ਦੇ ਨਪੁੰਸਕਤਾ ਦੀ ਇੱਕ ਵਿਸ਼ਾਲ ਸ਼੍ਰੇਣੀ ਦੁਆਰਾ ਦਰਸਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਟ੍ਰਾਂਸਮਿਸ਼ਨ, ਗਲਾਈਲ-ਵਿਚੋਲੇ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧਤਾ, ਅਤੇ ਮਾਈਟੋਕੌਂਡਰੀਅਲ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ (1-3) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਇਸਦੇ ਸਥਾਪਿਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਅਜੇ ਵੀ ਐਮੀਲੋਇਡ ਅਤੇ ਟਾਊ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਾ ਪਤਾ ਲਗਾਉਣ 'ਤੇ ਧਿਆਨ ਕੇਂਦ੍ਰਤ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਅਤੇ ਇਸਲਈ ਇਸ ਵਿਭਿੰਨ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਨੂੰ ਨਹੀਂ ਦਰਸਾ ਸਕਦੇ ਹਨ। ਇਹ "ਕੋਰ" ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਜੋ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਭਰੋਸੇਯੋਗ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸੇਰੀਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ (CSF) ਵਿੱਚ ਮਾਪਦੇ ਹਨ, ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ (i) ਐਮੀਲੋਇਡ ਬੀਟਾ ਪੇਪਟਾਇਡ 1-42 (Aβ1-42), ਜੋ ਕਿ ਕੋਰਟੀਕਲ ਐਮੀਲੋਇਡ ਪਲੇਕਸ ਦੇ ਗਠਨ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ; (ii) ਕੁੱਲ ਤਾਊ, axon degeneration ਦੀ ਨਿਸ਼ਾਨੀ; (iii) ਫਾਸਫੋ-ਟਾਊ (ਪੀ-ਟਾਊ), ਪੈਥੋਲੋਜੀਕਲ ਟਾਊ ਹਾਈਪਰਫੋਸਫੋਰਿਲੇਸ਼ਨ (4-7) ਦਾ ਪ੍ਰਤੀਨਿਧੀ। ਹਾਲਾਂਕਿ ਇਹ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਨੇ "ਨਿਸ਼ਾਨਬੱਧ" AD ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਰੋਗਾਂ (4-7) ਦੀ ਸਾਡੀ ਖੋਜ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਮਦਦ ਕੀਤੀ ਹੈ, ਉਹ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਪਿੱਛੇ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ ਦੇ ਸਿਰਫ ਇੱਕ ਛੋਟੇ ਹਿੱਸੇ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ।
AD ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਪਾਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀਕਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦੀ ਘਾਟ ਨੇ ਬਹੁਤ ਸਾਰੀਆਂ ਚੁਣੌਤੀਆਂ ਨੂੰ ਜਨਮ ਦਿੱਤਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ (i) AD ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਦੀ ਜੈਵਿਕ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਅਤੇ ਮਾਪਣ ਵਿੱਚ ਅਸਮਰੱਥਾ, (ii) ਬਿਮਾਰੀ ਦੀ ਤੀਬਰਤਾ ਅਤੇ ਤਰੱਕੀ ਦਾ ਨਾਕਾਫ਼ੀ ਮਾਪ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰੀਕਲੀਨਿਕਲ ਪੜਾਅ ਵਿੱਚ, ਅਤੇ ( iii) ਉਪਚਾਰਕ ਦਵਾਈਆਂ ਦਾ ਵਿਕਾਸ ਜੋ ਤੰਤੂ ਵਿਗਿਆਨਿਕ ਵਿਗਾੜ ਦੇ ਸਾਰੇ ਪਹਿਲੂਆਂ ਨੂੰ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਹੱਲ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਅਸਫਲ ਰਿਹਾ। ਸੰਬੰਧਿਤ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਤੋਂ AD ਦਾ ਵਰਣਨ ਕਰਨ ਲਈ ਲੈਂਡਮਾਰਕ ਪੈਥੋਲੋਜੀ 'ਤੇ ਸਾਡੀ ਨਿਰਭਰਤਾ ਸਿਰਫ ਇਨ੍ਹਾਂ ਸਮੱਸਿਆਵਾਂ ਨੂੰ ਵਧਾਉਂਦੀ ਹੈ। ਵੱਧ ਤੋਂ ਵੱਧ ਸਬੂਤ ਦਿਖਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ ਦਿਮਾਗੀ ਕਮਜ਼ੋਰੀ ਵਾਲੇ ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਬਜ਼ੁਰਗ ਲੋਕਾਂ ਵਿੱਚ ਬੋਧਾਤਮਕ ਗਿਰਾਵਟ (8) ਦੇ ਇੱਕ ਤੋਂ ਵੱਧ ਰੋਗ ਸੰਬੰਧੀ ਲੱਛਣ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। AD ਪੈਥੋਲੋਜੀ ਵਾਲੇ 90% ਜਾਂ ਵੱਧ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਨੂੰ ਵੀ ਨਾੜੀ ਰੋਗ, TDP-43 ਸੰਮਿਲਨ, ਜਾਂ ਹੋਰ ਡੀਜਨਰੇਟਿਵ ਬਿਮਾਰੀਆਂ (9) ਹਨ। ਪੈਥੋਲੋਜੀਕਲ ਓਵਰਲੈਪ ਦੇ ਇਹਨਾਂ ਉੱਚ ਅਨੁਪਾਤਾਂ ਨੇ ਡਿਮੈਂਸ਼ੀਆ ਲਈ ਸਾਡੇ ਮੌਜੂਦਾ ਡਾਇਗਨੌਸਟਿਕ ਢਾਂਚੇ ਨੂੰ ਵਿਗਾੜ ਦਿੱਤਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀ ਦੀ ਇੱਕ ਵਧੇਰੇ ਵਿਆਪਕ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀਕਲ ਪਰਿਭਾਸ਼ਾ ਦੀ ਲੋੜ ਹੈ।
AD ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਕਿਸਮ ਦੀ ਫੌਰੀ ਲੋੜ ਦੇ ਮੱਦੇਨਜ਼ਰ, ਖੇਤਰ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰਨ ਲਈ ਸਮੁੱਚੀ ਪ੍ਰਣਾਲੀ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ "ਓਮਿਕਸ" ਵਿਧੀ ਨੂੰ ਤੇਜ਼ੀ ਨਾਲ ਅਪਣਾ ਰਿਹਾ ਹੈ। ਐਕਸਲਰੇਟਿਡ ਫਾਰਮਾਸਿਊਟੀਕਲ ਪਾਰਟਨਰਸ਼ਿਪ (AMP)-AD ਅਲਾਇੰਸ 2014 ਵਿੱਚ ਲਾਂਚ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਗਰਾਮ ਵਿੱਚ ਸਭ ਤੋਂ ਅੱਗੇ ਹੈ। ਨੈਸ਼ਨਲ ਇੰਸਟੀਚਿਊਟ ਆਫ਼ ਹੈਲਥ, ਅਕਾਦਮਿਕ, ਅਤੇ ਉਦਯੋਗ ਦੁਆਰਾ ਇਸ ਬਹੁ-ਅਨੁਸ਼ਾਸਨੀ ਯਤਨ ਦਾ ਉਦੇਸ਼ AD ਦੇ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਨੂੰ ਬਿਹਤਰ ਢੰਗ ਨਾਲ ਪਰਿਭਾਸ਼ਿਤ ਕਰਨ ਅਤੇ ਜੈਵ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਡਾਇਗਨੌਸਟਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਇਲਾਜ ਰਣਨੀਤੀਆਂ (10) ਵਿਕਸਿਤ ਕਰਨ ਲਈ ਸਿਸਟਮ-ਆਧਾਰਿਤ ਰਣਨੀਤੀਆਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਨਾ ਹੈ। ਇਸ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਦੇ ਹਿੱਸੇ ਵਜੋਂ, ਨੈੱਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ AD ਵਿੱਚ ਸਿਸਟਮ-ਅਧਾਰਿਤ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਉੱਨਤੀ ਲਈ ਇੱਕ ਵਧੀਆ ਸਾਧਨ ਬਣ ਗਿਆ ਹੈ। ਇਹ ਨਿਰਪੱਖ ਡਾਟਾ-ਸੰਚਾਲਿਤ ਪਹੁੰਚ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟਾਂ ਨੂੰ ਸਮੂਹਾਂ ਜਾਂ ਸਹਿ-ਪ੍ਰਗਟਾਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਦੇ "ਮੌਡਿਊਲਾਂ" ਵਿੱਚ ਸੰਗਠਿਤ ਕਰਦੀ ਹੈ ਜੋ ਖਾਸ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮਾਂ, ਅੰਗਾਂ, ਅਤੇ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਫੰਕਸ਼ਨਾਂ (11-13) ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਹਨ। AD ਦਿਮਾਗ (13-23) 'ਤੇ ਲਗਭਗ 12 ਜਾਣਕਾਰੀ-ਅਮੀਰ ਨੈਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਅਧਿਐਨ ਕੀਤੇ ਗਏ ਹਨ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ AD ਦਿਮਾਗ ਨੈਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਸੁਤੰਤਰ ਸਮੂਹਾਂ ਅਤੇ ਮਲਟੀਪਲ ਕੋਰਟੀਕਲ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਉੱਚ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਮਾਡਯੂਲਰ ਸੰਗਠਨ ਨੂੰ ਕਾਇਮ ਰੱਖਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਕੁਝ ਮੋਡੀਊਲ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟਾਂ ਵਿੱਚ AD-ਸੰਬੰਧੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਜਨਨਯੋਗ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਜੋ ਕਿ ਕਈ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਦੇ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਸਮੂਹਿਕ ਤੌਰ 'ਤੇ, ਇਹ ਖੋਜਾਂ AD ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਸਿਸਟਮ-ਅਧਾਰਿਤ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਬ੍ਰੇਨ ਨੈਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਖੋਜ ਲਈ ਇੱਕ ਸ਼ਾਨਦਾਰ ਐਂਕਰ ਪੁਆਇੰਟ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਕਰਦੀਆਂ ਹਨ।
AD ਬ੍ਰੇਨ ਨੈਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਨੂੰ ਕਲੀਨਿਕੀ ਤੌਰ 'ਤੇ ਉਪਯੋਗੀ ਸਿਸਟਮ-ਅਧਾਰਿਤ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਵਿੱਚ ਬਦਲਣ ਲਈ, ਅਸੀਂ AD CSF ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਨਾਲ ਬ੍ਰੇਨ-ਪ੍ਰਾਪਤ ਨੈੱਟਵਰਕ ਨੂੰ ਜੋੜਿਆ ਹੈ। ਇਸ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਪਹੁੰਚ ਨੇ CSF ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਪੰਜ ਹੋਨਹਾਰ ਸੈੱਟਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ ਜੋ ਦਿਮਾਗ-ਅਧਾਰਤ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਦੀ ਇੱਕ ਵਿਸ਼ਾਲ ਸ਼੍ਰੇਣੀ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਹਨ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਸਿਨੈਪਸ, ਖੂਨ ਦੀਆਂ ਨਾੜੀਆਂ, ਮਾਈਲਿਨੇਸ਼ਨ, ਸੋਜਸ਼, ਅਤੇ ਪਾਚਕ ਮਾਰਗਾਂ ਦੇ ਨਪੁੰਸਕਤਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਅਸੀਂ ਇਹਨਾਂ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਪੈਨਲਾਂ ਨੂੰ ਕਈ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਦੁਆਰਾ ਸਫਲਤਾਪੂਰਵਕ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕੀਤਾ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਨਿਊਰੋਡੀਜਨਰੇਟਿਵ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਦੇ 500 ਤੋਂ ਵੱਧ CSF ਨਮੂਨੇ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਪ੍ਰਮਾਣਿਕਤਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਵਿੱਚ ਲੱਛਣਾਂ ਵਾਲੇ AD (AsymAD) ਵਾਲੇ ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਦੇ CSF ਵਿੱਚ ਸਮੂਹ ਟੀਚਿਆਂ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਨਾ ਜਾਂ ਇੱਕ ਆਮ ਬੋਧਾਤਮਕ ਵਾਤਾਵਰਣ ਵਿੱਚ ਅਸਧਾਰਨ ਐਮੀਲੋਇਡ ਇਕੱਤਰ ਹੋਣ ਦਾ ਸਬੂਤ ਦਿਖਾਉਣਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਇਹ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ AsymAD ਆਬਾਦੀ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਣ ਜੈਵਿਕ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਪੈਨਲ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਦੇ ਹਨ ਜੋ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਪੜਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਨੂੰ ਉਪ-ਕਿਸਮ ਕਰਨ ਦੇ ਯੋਗ ਹੋ ਸਕਦੇ ਹਨ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਨਤੀਜੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੂਲਜ਼ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮੁੱਖ ਕਦਮ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਜੋ ਮਲਟੀਪਲ ਪ੍ਰਣਾਲੀਆਂ 'ਤੇ ਅਧਾਰਤ ਹਨ ਜੋ AD ਦੁਆਰਾ ਦਰਪੇਸ਼ ਬਹੁਤ ਸਾਰੀਆਂ ਕਲੀਨਿਕਲ ਚੁਣੌਤੀਆਂ ਨੂੰ ਸਫਲਤਾਪੂਰਵਕ ਹੱਲ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ।
ਇਸ ਅਧਿਐਨ ਦਾ ਮੁੱਖ ਉਦੇਸ਼ ਨਵੇਂ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨਾ ਹੈ ਜੋ ਕਿ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਦਿਮਾਗ-ਅਧਾਰਤ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਜੋ ਕਿ ਏ.ਡੀ. ਚਿੱਤਰ S1 ਸਾਡੀ ਖੋਜ ਕਾਰਜਪ੍ਰਣਾਲੀ ਦੀ ਰੂਪਰੇਖਾ ਦਿੰਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ (i) AD CSF ਦੀਆਂ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਖੋਜਾਂ ਦੁਆਰਾ ਸੰਚਾਲਿਤ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਕਈ ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ CSF ਰੋਗ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਲਈ ਨੈਟਵਰਕ ਬ੍ਰੇਨ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ, ਅਤੇ (ii) ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਇਹ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਕਈ ਸੁਤੰਤਰ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਵਿੱਚ ਹਨ। ਤਰਲ ਸਮੂਹ. ਖੋਜ-ਅਧਾਰਿਤ ਖੋਜ ਐਮੋਰੀ ਗੋਇਜ਼ੁਏਟਾ ਅਲਜ਼ਾਈਮਰ ਰੋਗ ਖੋਜ ਕੇਂਦਰ (ADRC) ਵਿਖੇ 20 ਬੋਧਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਆਮ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਅਤੇ 20 AD ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਵਿੱਚ CSF ਦੇ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨਾਲ ਸ਼ੁਰੂ ਹੋਈ। AD ਦੇ ਨਿਦਾਨ ਨੂੰ ਘੱਟ Aβ1-42 ਦੀ ਮੌਜੂਦਗੀ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਬੋਧਾਤਮਕ ਕਮਜ਼ੋਰੀ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਪਰਿਭਾਸ਼ਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ ਅਤੇ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਵਿੱਚ ਕੁੱਲ ਟਾਊ ਅਤੇ ਪੀ-ਟਾਊ ਦੇ ਉੱਚੇ ਪੱਧਰ [ਮੀਨ ਮਾਂਟਰੀਅਲ ਕੋਗਨਿਟਿਵ ਅਸੈਸਮੈਂਟ (MoCA), 13.8 ± 7.0] [ELISA (ELISA) )]] (ਸਾਰਣੀ S1A)। ਨਿਯੰਤਰਣ (ਮਤਲਬ MoCA, 26.7 ± 2.2) ਵਿੱਚ CSF ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਆਮ ਪੱਧਰ ਸਨ।
ਮਨੁੱਖੀ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੀ ਇੱਕ ਗਤੀਸ਼ੀਲ ਰੇਂਜ ਦੁਆਰਾ ਦਰਸਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਐਲਬਿਊਮਿਨ ਅਤੇ ਹੋਰ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਭਰਪੂਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਿਲਚਸਪੀ ਵਾਲੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਖੋਜ ਨੂੰ ਰੋਕ ਸਕਦੇ ਹਨ (24). ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਖੋਜ ਦੀ ਡੂੰਘਾਈ ਨੂੰ ਵਧਾਉਣ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਮਾਸ ਸਪੈਕਟ੍ਰੋਮੈਟਰੀ (ਐੱਮ.ਐੱਸ.) ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (24) ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ ਹਰੇਕ CSF ਨਮੂਨੇ ਤੋਂ ਪਹਿਲੇ 14 ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਭਰਪੂਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਹਟਾ ਦਿੱਤੇ। ਐਮਐਸ ਦੁਆਰਾ ਕੁੱਲ 39,805 ਪੇਪਟਾਇਡਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਨੂੰ 40 ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ 3691 ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਨਾਲ ਮੈਪ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ। ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ ਮਲਟੀਪਲ ਟੈਂਡਮ ਮਾਸ ਟੈਗ (ਟੀਐਮਟੀ) ਲੇਬਲਿੰਗ (18, 25) ਦੁਆਰਾ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਗੁੰਮ ਹੋਏ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕਰਨ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਸਿਰਫ ਉਹਨਾਂ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕੀਤਾ ਜੋ ਬਾਅਦ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਘੱਟੋ-ਘੱਟ 50% ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਮਾਪਿਆ ਗਿਆ ਸੀ, ਇਸ ਤਰ੍ਹਾਂ ਅੰਤ ਵਿੱਚ 2875 ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ। ਕੁੱਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੇ ਪੱਧਰਾਂ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਅੰਤਰ ਦੇ ਕਾਰਨ, ਇੱਕ ਨਿਯੰਤਰਣ ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਇੱਕ ਆਊਟਲੀਅਰ (13) ਮੰਨਿਆ ਗਿਆ ਸੀ ਅਤੇ ਬਾਅਦ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਨਹੀਂ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ। ਬਾਕੀ ਬਚੇ 39 ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੇ ਮੁੱਲਾਂ ਨੂੰ ਉਮਰ, ਲਿੰਗ, ਅਤੇ ਬੈਚ ਕੋਵੇਰੀਅੰਸ (13-15, 17, 18, 20, 26) ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ ਐਡਜਸਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।
ਰਿਗਰੈਸ਼ਨ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ 'ਤੇ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਨ ਲਈ ਅੰਕੜਾ ਟੀ-ਟੈਸਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, ਇਸ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੇ ਪੱਧਰਾਂ ਨੂੰ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ AD ਕੇਸਾਂ (ਟੇਬਲ S2A) ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਦਲਿਆ ਗਿਆ ਸੀ (P <0.05). ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਚਿੱਤਰ 1A ਵਿੱਚ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ, AD ਵਿੱਚ ਕੁੱਲ 225 ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਵਿੱਚ ਕਾਫ਼ੀ ਕਮੀ ਆਈ ਸੀ, ਅਤੇ 303 ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਵਿੱਚ ਕਾਫ਼ੀ ਵਾਧਾ ਹੋਇਆ ਸੀ। ਇਹਨਾਂ ਵਿਭਿੰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਗਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚ ਕਈ ਪਹਿਲਾਂ ਪਛਾਣੇ ਗਏ ਸੇਰਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ AD ਮਾਰਕਰ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਮਾਈਕ੍ਰੋਟਿਊਬਿਊਲ-ਸਬੰਧਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਟਾਊ (MAPT; P = 3.52 × 10−8), ਨਿਊਰੋਫਿਲਾਮੈਂਟ (NEFL; P = 6.56 × 10−3), ਵਿਕਾਸ-ਸਬੰਧਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ 43। (GAP43; P = 1.46 × 10−5), ਫੈਟੀ ਐਸਿਡ ਬਾਈਡਿੰਗ ਪ੍ਰੋਟੀਨ 3 (FABP3; P = 2.00 × 10−5), Chitinase 3 ਵਰਗਾ 1 (CHI3L1; P = 4.44 × 10−6), ਨਿਊਰਲ ਗ੍ਰੈਨਿਊਲਿਨ (NRGN; P = 3.43 × 10−4) ਅਤੇ VGF ਨਰਵ ਵਿਕਾਸ ਕਾਰਕ (VGF; P = 4.83 × 10−3) (4-6)। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਅਸੀਂ ਹੋਰ ਬਹੁਤ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਟੀਚਿਆਂ ਦੀ ਵੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ GDP ਡਿਸਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਇਨਿਹਿਬਟਰ 1 (GDI1; P = 1.54 × 10-10) ਅਤੇ SPARC-ਸਬੰਧਤ ਮਾਡਯੂਲਰ ਕੈਲਸ਼ੀਅਮ ਬਾਈਡਿੰਗ 1 (SMOC1; P = 6.93 × 10-9)। 225 ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਘਟਾਏ ਗਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਜੀਨ ਔਨਟੋਲੋਜੀ (GO) ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਸਰੀਰ ਦੇ ਤਰਲ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਸਟੀਰੌਇਡ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ, ਖੂਨ ਦੇ ਜੰਮਣ, ਅਤੇ ਹਾਰਮੋਨ ਗਤੀਵਿਧੀ (ਚਿੱਤਰ 1B ਅਤੇ ਟੇਬਲ S2B) ਨਾਲ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਸਬੰਧਾਂ ਦਾ ਖੁਲਾਸਾ ਕੀਤਾ। ਇਸ ਦੇ ਉਲਟ, 303 ਦੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਧੇ ਹੋਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਾ ਸੈੱਲ ਬਣਤਰ ਅਤੇ ਊਰਜਾ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ ਨਾਲ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਸਬੰਧ ਹੈ।
(ਏ) ਜੁਆਲਾਮੁਖੀ ਪਲਾਟ ਟੀ-ਟੈਸਟ ਦੁਆਰਾ ਪ੍ਰਾਪਤ -ਲੌਗ10 ਅੰਕੜਾ ਪੀ ਮੁੱਲ (y-ਧੁਰਾ) ਦੇ ਅਨੁਸਾਰੀ ਲੌਗ2 ਫੋਲਡ ਪਰਿਵਰਤਨ (x-ਧੁਰਾ) ਦਿਖਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਨਿਯੰਤਰਣ (CT) ਅਤੇ ਵਿਚਕਾਰ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਾ ਪਤਾ ਲਗਾਉਣ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਸਾਰੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਦੇ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ AD ਕੇਸ। AD ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਘਟੇ ਹੋਏ ਪੱਧਰਾਂ (P <0.05) ਵਾਲੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੂੰ ਨੀਲੇ ਰੰਗ ਵਿੱਚ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਬਿਮਾਰੀ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਧੇ ਹੋਏ ਪੱਧਰਾਂ ਵਾਲੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਲਾਲ ਰੰਗ ਵਿੱਚ ਦਿਖਾਏ ਗਏ ਹਨ। ਚੁਣੇ ਹੋਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੂੰ ਲੇਬਲ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। (ਬੀ) ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਚੋਟੀ ਦੇ ਜੀਓ ਸ਼ਬਦ AD ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਘਟਾਏ ਗਏ (ਨੀਲੇ) ਅਤੇ ਵਧੇ ਹੋਏ (ਲਾਲ) ਹਨ। ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ, ਅਣੂ ਫੰਕਸ਼ਨਾਂ, ਅਤੇ ਸੈਲੂਲਰ ਭਾਗਾਂ ਦੇ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਉੱਚਤਮ z-ਸਕੋਰਾਂ ਵਾਲੇ ਤਿੰਨ GO ਸ਼ਬਦਾਂ ਨੂੰ ਦਿਖਾਉਂਦਾ ਹੈ। (C) MS ਨੇ CSF ਨਮੂਨੇ (ਖੱਬੇ) ਵਿੱਚ ਮਾਪਿਆ MAPT ਪੱਧਰ ਅਤੇ ਨਮੂਨਾ ELISA tau ਪੱਧਰ (ਸੱਜੇ) ਨਾਲ ਇਸਦਾ ਸਬੰਧ। ਸੰਬੰਧਿਤ P ਮੁੱਲ ਦੇ ਨਾਲ ਪੀਅਰਸਨ ਸਹਿ-ਸੰਬੰਧ ਗੁਣਾਂਕ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। ਇੱਕ AD ਕੇਸ ਲਈ ELISA ਡੇਟਾ ਦੀ ਘਾਟ ਕਾਰਨ, ਇਹਨਾਂ ਅੰਕੜਿਆਂ ਵਿੱਚ 39 ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤੇ ਕੇਸਾਂ ਵਿੱਚੋਂ 38 ਲਈ ਮੁੱਲ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। (ਡੀ) ਨਿਯੰਤਰਣ 'ਤੇ ਨਿਰੀਖਣ ਕੀਤੇ ਕਲੱਸਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (ਪੀ <0.0001, ਬੈਂਜਾਮਿਨੀ-ਹੋਚਬਰਗ (ਬੀ.ਐਚ.) ਐਡਜਸਟਡ ਪੀ <0.01) ਅਤੇ AD CSF ਨੇ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਵਿੱਚ 65 ਸਭ ਤੋਂ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਬਦਲੇ ਹੋਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਨਮੂਨੇ ਲੱਭੇ। ਮਿਆਰੀਕਰਨ, ਆਮ ਕਰਨਾ.
MAPT ਦਾ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕ ਪੱਧਰ ਸੁਤੰਤਰ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮਾਪਿਆ ਗਿਆ ELISA tau ਪੱਧਰ (r = 0.78, P = 7.8 × 10-9; ਚਿੱਤਰ 1C), ਸਾਡੇ MS ਮਾਪ ਦੀ ਵੈਧਤਾ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਐਮੀਲੋਇਡ ਪ੍ਰੀਕਰਸਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (ਏਪੀਪੀ) ਦੇ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਟ੍ਰਾਈਪਸਿਨ ਪਾਚਨ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, Aβ1-40 ਅਤੇ Aβ1-42 ਦੇ ਸੀ-ਟਰਮੀਨਸ ਨਾਲ ਮੈਪ ਕੀਤੇ ਆਈਸੋਫਾਰਮ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਪੇਪਟਾਇਡਾਂ ਨੂੰ ਕੁਸ਼ਲਤਾ ਨਾਲ ਆਇਓਨਾਈਜ਼ ਨਹੀਂ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ (27, 28). ਇਸ ਲਈ, ਸਾਡੇ ਦੁਆਰਾ ਪਛਾਣੇ ਗਏ APP ਪੇਪਟਾਇਡਸ ਦਾ ELISA Aβ1-42 ਪੱਧਰਾਂ ਨਾਲ ਕੋਈ ਲੈਣਾ-ਦੇਣਾ ਨਹੀਂ ਹੈ। ਹਰੇਕ ਕੇਸ ਦੇ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਨ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਨਮੂਨਿਆਂ (ਟੇਬਲ S2A) ਦੇ ਨਿਰੀਖਣ ਕੀਤੇ ਕਲੱਸਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਕਰਨ ਲਈ P <0.0001 [ਗਲਤ ਖੋਜ ਦਰ (FDR) ਠੀਕ ਕੀਤਾ P <0.01] ਨਾਲ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ। ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਚਿੱਤਰ 1D ਵਿੱਚ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ, ਇਹ 65 ਬਹੁਤ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਰੋਗ ਸਥਿਤੀ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ ਸਹੀ ਢੰਗ ਨਾਲ ਨਮੂਨੇ ਕਲੱਸਟਰ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਨਿਯੰਤਰਣ ਵਰਗੀਆਂ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਵਾਲੇ ਇੱਕ AD ਕੇਸ ਨੂੰ ਛੱਡ ਕੇ। ਇਹਨਾਂ 65 ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ, 63 AD ਵਿੱਚ ਵਧੇ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਸਿਰਫ ਦੋ (CD74 ਅਤੇ ISLR) ਘਟੇ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹਨਾਂ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਨੇ AD ਵਿੱਚ ਸੈਂਕੜੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ ਹੈ ਜੋ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਵਜੋਂ ਕੰਮ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ।
ਫਿਰ ਅਸੀਂ AD ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦਾ ਇੱਕ ਸੁਤੰਤਰ ਨੈਟਵਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ। ਇਸ ਖੋਜ ਦੇ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਨਿਯੰਤਰਣ (n = 10), ਪਾਰਕਿੰਸਨ'ਸ ਰੋਗ (PD; n = 10), ਮਿਸ਼ਰਤ AD/PD (n = 10) ਅਤੇ AD (n = 10) ਕੇਸਾਂ ਤੋਂ ਡੋਰਸੋਲੇਟਰਲ ਪ੍ਰੀਫ੍ਰੰਟਲ ਕਾਰਟੈਕਸ (DLPFC) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ) ਨਮੂਨਾ. Emery Goizueta ADRC. ਇਹਨਾਂ 40 ਮਾਮਲਿਆਂ ਦੀ ਜਨਸੰਖਿਆ ਪਹਿਲਾਂ ਦੱਸੀ ਗਈ ਹੈ (25) ਅਤੇ ਸਾਰਣੀ S1B ਵਿੱਚ ਸੰਖੇਪ ਹਨ। ਅਸੀਂ ਇਹਨਾਂ 40 ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਅਤੇ 27 ਮਾਮਲਿਆਂ ਦੇ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਸਮੂਹ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ TMT-MS ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹਨਾਂ ਦੋ ਦਿਮਾਗੀ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟਾਂ ਨੇ 227,121 ਵਿਲੱਖਣ ਪੇਪਟਾਇਡਸ ਪੈਦਾ ਕੀਤੇ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਨੂੰ 12,943 ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ (25) ਨਾਲ ਮੈਪ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ। ਸਿਰਫ ਉਹ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਜੋ ਘੱਟੋ-ਘੱਟ 50% ਕੇਸਾਂ ਵਿੱਚ ਮਾਪਦੰਡ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ, ਬਾਅਦ ਦੀਆਂ ਜਾਂਚਾਂ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ। ਅੰਤਮ ਖੋਜ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਵਿੱਚ 8817 ਮਾਤਰਾਵਾਂ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਉਮਰ, ਲਿੰਗ, ਅਤੇ ਪੋਸਟ-ਮਾਰਟਮ ਅੰਤਰਾਲ (PMI) ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੇ ਪੱਧਰਾਂ ਨੂੰ ਵਿਵਸਥਿਤ ਕਰੋ। ਰਿਗਰੈਸ਼ਨ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਸੈੱਟ ਕੀਤੇ ਗਏ ਡੇਟਾ ਦੇ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਦਿਖਾਇਆ ਕਿ > 2000 ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਪੱਧਰਾਂ ਵਿੱਚ ਦੋ ਜਾਂ ਦੋ ਤੋਂ ਵੱਧ ਰੋਗਾਂ ਦੇ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ [ਪੀ <0.05, ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (ANOVA)] ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਬਦਲਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਫਿਰ, ਅਸੀਂ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ, ਅਤੇ AD/ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ/ਜਾਂ AD/PD ਤੁਲਨਾਵਾਂ (ਚਿੱਤਰ S2, A ਅਤੇ B, ਟੇਬਲ S2C) ਵਿੱਚ P <0.0001 ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਇੱਕ ਨਿਰੀਖਣ ਕੀਤਾ ਕਲੱਸਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ। ਇਹ 165 ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਬਦਲੇ ਹੋਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ ਪੀਡੀ ਨਮੂਨਿਆਂ ਤੋਂ AD ਪੈਥੋਲੋਜੀ ਵਾਲੇ ਕੇਸਾਂ ਨੂੰ ਸਪੱਸ਼ਟ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਪੂਰੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ ਮਜ਼ਬੂਤ AD-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੀ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕਰਦੇ ਹਨ।
ਅਸੀਂ ਫਿਰ ਖੋਜੇ ਗਏ ਬ੍ਰੇਨ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ 'ਤੇ ਨੈਟਵਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਵੇਟਡ ਜੀਨ ਕੋ-ਐਕਸਪ੍ਰੇਸ਼ਨ ਨੈਟਵਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (ਡਬਲਯੂਜੀਸੀਐਨਏ) ਨਾਮਕ ਇੱਕ ਐਲਗੋਰਿਦਮ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ, ਜੋ ਸਮਾਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪੈਟਰਨਾਂ (11-13) ਦੇ ਨਾਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਡੀਊਲ ਵਿੱਚ ਸੈੱਟ ਕੀਤੇ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਸੰਗਠਿਤ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਡੇ (M1, n = 1821 ਪ੍ਰੋਟੀਨ) ਤੋਂ ਸਭ ਤੋਂ ਛੋਟੇ (M44, n = 34 ਪ੍ਰੋਟੀਨ) (ਚਿੱਤਰ 2A ਅਤੇ ਸਾਰਣੀ S2D) ਤੱਕ 44 ਮੋਡੀਊਲ (M) ਸਹਿ-ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ, ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਅਤੇ ਸੰਖਿਆਬੱਧ ਕੀਤੇ ਗਏ ਹਨ। ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਉੱਪਰ ਦੱਸਿਆ ਗਿਆ ਹੈ (13) ਹਰੇਕ ਮੋਡੀਊਲ ਦੇ ਪ੍ਰਤੀਨਿਧੀ ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲ ਜਾਂ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰੋ, ਅਤੇ ਇਸਨੂੰ ਬਿਮਾਰੀ ਦੀ ਸਥਿਤੀ ਅਤੇ AD ਪੈਥੋਲੋਜੀ ਨਾਲ ਜੋੜੋ, ਯਾਨੀ ਅਲਜ਼ਾਈਮਰ ਰੋਗ ਰਜਿਸਟਰੀ (CERAD) ਅਤੇ ਬ੍ਰੇਕ ਸਕੋਰ (ਚਿੱਤਰ 2B) ਦਾ ਗਠਜੋੜ ਸਥਾਪਿਤ ਕਰੋ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, 17 ਮੈਡਿਊਲ AD ਨਿਊਰੋਪੈਥੋਲੋਜੀ (ਪੀ <0.05) ਨਾਲ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ ਸਨ। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਰੋਗ-ਸਬੰਧਤ ਮੋਡੀਊਲ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਮਾਰਕਰਾਂ (ਚਿੱਤਰ 2B) ਵਿੱਚ ਵੀ ਅਮੀਰ ਹਨ। ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਉੱਪਰ ਦੱਸਿਆ ਗਿਆ ਹੈ (13), ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਨੂੰ ਮੋਡੀਊਲ ਓਵਰਲੈਪ ਅਤੇ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਸੰਦਰਭ ਸੂਚੀ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਕੇ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਜੀਨ ਅਲੱਗ-ਥਲੱਗ ਮਾਊਸ ਨਿਊਰੋਨਸ, ਐਂਡੋਥੈਲਿਅਲ ਅਤੇ ਗਲਾਈਅਲ ਸੈੱਲਾਂ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਡੇਟਾ ਤੋਂ ਲਏ ਗਏ ਹਨ। RNA ਕ੍ਰਮ (RNA-seq) ਪ੍ਰਯੋਗ (29)।
(ਏ) ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਡਬਲਯੂਜੀਸੀਐਨਏ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰੋ। (ਬੀ) ਮਾਡਯੂਲਰ ਸਿਗਨੇਚਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (ਮਾਡਿਊਲਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਾ ਪਹਿਲਾ ਮੁੱਖ ਹਿੱਸਾ) ਦਾ ਬਾਈਵੇਟ ਮਿਡਕੋਰਲੇਸ਼ਨ (ਬੀਕੋਰ) ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ AD ਨਿਊਰੋਪੈਥੋਲੋਜੀਕਲ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ (ਸਿਖਰ) ਦੇ ਨਾਲ, CERAD (Aβ ਪਲੇਕ) ਅਤੇ ਬ੍ਰੈਕ (ਟਾਊ ਟੈਂਗਲਜ਼) ਸਕੋਰ ਸਮੇਤ. ਸਕਾਰਾਤਮਕ (ਲਾਲ) ਅਤੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ (ਨੀਲੇ) ਸਬੰਧਾਂ ਦੀ ਤੀਬਰਤਾ ਦੋ-ਰੰਗ ਦੇ ਤਾਪ ਨਕਸ਼ੇ ਦੁਆਰਾ ਦਰਸਾਈ ਗਈ ਹੈ, ਅਤੇ ਤਾਰੇ ਅੰਕੜਾ ਮਹੱਤਵ (ਪੀ <0.05) ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਹਰੇਕ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਡੀਊਲ ਦੇ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ ਦੇ ਸਬੰਧ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਨ ਲਈ ਹਾਈਪਰਜੀਓਮੈਟ੍ਰਿਕ ਫਿਸ਼ਰਜ਼ ਐਕਸੈਕਟ ਟੈਸਟ (FET) (ਹੇਠਾਂ) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰੋ। ਲਾਲ ਰੰਗਤ ਦੀ ਤੀਬਰਤਾ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਦੀ ਡਿਗਰੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ, ਅਤੇ ਤਾਰਾ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਮਹੱਤਤਾ (ਪੀ <0.05) ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ। FET ਤੋਂ ਪ੍ਰਾਪਤ P ਮੁੱਲ ਨੂੰ ਠੀਕ ਕਰਨ ਲਈ BH ਵਿਧੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰੋ। (C) ਮਾਡਿਊਲਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਾ GO ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ। ਹਰੇਕ ਮੋਡੀਊਲ ਜਾਂ ਸਬੰਧਤ ਮੋਡੀਊਲ ਸਮੂਹ ਲਈ ਸਭ ਤੋਂ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਸਬੰਧਿਤ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਦਿਖਾਈਆਂ ਗਈਆਂ ਹਨ। oligo, oligodendrocyte.
ਪੰਜ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਸਬੰਧਿਤ ਐਸਟ੍ਰੋਸਾਈਟ ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਗਲੀਆ-ਅਮੀਰ ਮੋਡੀਊਲ (M30, M29, M18, M24, ਅਤੇ M5) ਦੇ ਇੱਕ ਸਮੂਹ ਨੇ AD ਨਿਊਰੋਪੈਥੋਲੋਜੀ (ਚਿੱਤਰ 2B) ਨਾਲ ਇੱਕ ਮਜ਼ਬੂਤ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਸਬੰਧ ਦਿਖਾਇਆ। ਓਨਟੋਲੋਜੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਇਹਨਾਂ ਗਲਾਈਅਲ ਮੋਡੀਊਲਾਂ ਨੂੰ ਸੈੱਲ ਵਿਕਾਸ, ਪ੍ਰਸਾਰ ਅਤੇ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧਕਤਾ (ਚਿੱਤਰ 2C ਅਤੇ ਸਾਰਣੀ S2E) ਨਾਲ ਜੋੜਦਾ ਹੈ। ਦੋ ਵਾਧੂ glial ਮੋਡੀਊਲ, M8 ਅਤੇ M22, ਵੀ ਬਿਮਾਰੀ ਵਿੱਚ ਮਜ਼ਬੂਤੀ ਨਾਲ ਅਪਰੇਗੂਲੇਟ ਕੀਤੇ ਗਏ ਹਨ। M8 ਟੋਲ-ਵਰਗੇ ਰੀਸੈਪਟਰ ਪਾਥਵੇਅ ਨਾਲ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਸੰਬੰਧਿਤ ਹੈ, ਇੱਕ ਸਿਗਨਲ ਕੈਸਕੇਡ ਜੋ ਕਿ ਪੈਦਾਇਸ਼ੀ ਇਮਿਊਨ ਪ੍ਰਤੀਕਿਰਿਆ (30) ਵਿੱਚ ਮੁੱਖ ਭੂਮਿਕਾ ਨਿਭਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਉਸੇ ਸਮੇਂ, M22 ਪੋਸਟ-ਅਨੁਵਾਦਕ ਸੋਧ ਨਾਲ ਨੇੜਿਓਂ ਸਬੰਧਤ ਹੈ। M2, ਜੋ ਕਿ oligodendrocytes ਵਿੱਚ ਅਮੀਰ ਹੈ, AD ਪੈਥੋਲੋਜੀ ਨਾਲ ਇੱਕ ਮਜ਼ਬੂਤ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਸਬੰਧ ਅਤੇ ਨਿਊਕਲੀਓਸਾਈਡ ਸੰਸਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਡੀਐਨਏ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਓਨਟੋਲੋਜੀਕਲ ਸਬੰਧ ਦਿਖਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਵਿੱਚ ਵਧੇ ਹੋਏ ਸੈੱਲ ਪ੍ਰਸਾਰ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਖੋਜਾਂ glial ਮੌਡਿਊਲਾਂ ਦੀ ਉਚਾਈ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਦੀਆਂ ਹਨ ਜੋ ਅਸੀਂ ਪਹਿਲਾਂ AD ਨੈੱਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ (13, 17) ਵਿੱਚ ਦੇਖਿਆ ਹੈ। ਵਰਤਮਾਨ ਵਿੱਚ ਇਹ ਪਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ ਕਿ ਨੈਟਵਰਕ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ AD-ਸਬੰਧਤ ਗਲੀਅਲ ਮੋਡੀਊਲ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ PD ਕੇਸਾਂ ਵਿੱਚ ਨਿਮਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪੱਧਰ ਦਿਖਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਉਹਨਾਂ ਦੀ ਬਿਮਾਰੀ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦੇ ਹਨ ਜੋ AD (ਚਿੱਤਰ S2C) ਵਿੱਚ ਉੱਚਾ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
ਸਾਡੇ ਨੈੱਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ (M1, M3, M10, ਅਤੇ M32) ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ਼ ਚਾਰ ਮੋਡੀਊਲ ਹੀ AD ਪੈਥੋਲੋਜੀ (P <0.05) (ਚਿੱਤਰ 2, B ਅਤੇ C) ਨਾਲ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਬੰਧਿਤ ਹਨ। M1 ਅਤੇ M3 ਦੋਵੇਂ ਨਿਊਰੋਨਲ ਮਾਰਕਰਾਂ ਨਾਲ ਭਰਪੂਰ ਹਨ। M1 ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਸਿਗਨਲਾਂ ਨਾਲ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਸਬੰਧਤ ਹੈ, ਜਦੋਂ ਕਿ M3 ਮਾਈਟੋਕੌਂਡਰੀਅਲ ਫੰਕਸ਼ਨ ਨਾਲ ਨੇੜਿਓਂ ਸਬੰਧਤ ਹੈ। M10 ਅਤੇ M32 ਲਈ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਦਾ ਕੋਈ ਸਬੂਤ ਨਹੀਂ ਹੈ। M32 M3 ਅਤੇ ਸੈੱਲ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਜਦੋਂ ਕਿ M10 ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਸੈੱਲ ਵਿਕਾਸ ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਟਿਊਬਿਊਲ ਫੰਕਸ਼ਨ ਨਾਲ ਸੰਬੰਧਿਤ ਹੈ। AD ਦੇ ਮੁਕਾਬਲੇ, ਸਾਰੇ ਚਾਰ ਮੋਡੀਊਲ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ PD ਵਿੱਚ ਵਧੇ ਹੋਏ ਹਨ, ਉਹਨਾਂ ਨੂੰ ਰੋਗ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ AD ਬਦਲਾਅ (ਚਿੱਤਰ S2C) ਦਿੰਦੇ ਹਨ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਨਤੀਜੇ ਨਿਊਰੋਨ-ਅਮੀਰ ਮਾਡਿਊਲਾਂ ਦੀ ਘਟੀ ਹੋਈ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਦੇ ਹਨ ਜੋ ਅਸੀਂ ਪਹਿਲਾਂ AD (13, 17) ਵਿੱਚ ਦੇਖਿਆ ਹੈ। ਸੰਖੇਪ ਵਿੱਚ, ਬ੍ਰੇਨ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦਾ ਨੈੱਟਵਰਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਜੋ ਅਸੀਂ ਖੋਜਿਆ ਹੈ, ਸਾਡੀਆਂ ਪਿਛਲੀਆਂ ਖੋਜਾਂ ਨਾਲ ਮੇਲ ਖਾਂਦਾ AD-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਦਲੇ ਗਏ ਮੋਡੀਊਲ ਦਾ ਉਤਪਾਦਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
AD ਇੱਕ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਅਸੈਂਪਟੋਮੈਟਿਕ ਪੜਾਅ (AsymAD) ਦੁਆਰਾ ਦਰਸਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਵਿਅਕਤੀ ਕਲੀਨਿਕਲ ਬੋਧਾਤਮਕ ਗਿਰਾਵਟ (5, 31) ਤੋਂ ਬਿਨਾਂ ਐਮੀਲੋਇਡ ਸੰਚਵ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਇਹ ਅਸੈਂਪਟੋਮੈਟਿਕ ਪੜਾਅ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਖੋਜ ਅਤੇ ਦਖਲਅੰਦਾਜ਼ੀ ਲਈ ਇੱਕ ਨਾਜ਼ੁਕ ਵਿੰਡੋ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਅਸੀਂ ਪਹਿਲਾਂ ਸੁਤੰਤਰ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟਾਂ (13, 17) ਵਿੱਚ AsymAD ਅਤੇ AD ਦਿਮਾਗ ਨੈਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਮਜ਼ਬੂਤ ਮਾਡਯੂਲਰ ਸੰਭਾਲ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਕੀਤਾ ਹੈ। ਇਹ ਸੁਨਿਸ਼ਚਿਤ ਕਰਨ ਲਈ ਕਿ ਸਾਡੇ ਦੁਆਰਾ ਖੋਜਿਆ ਗਿਆ ਦਿਮਾਗ ਦਾ ਨੈਟਵਰਕ ਇਹਨਾਂ ਪਿਛਲੀਆਂ ਖੋਜਾਂ ਨਾਲ ਮੇਲ ਖਾਂਦਾ ਹੈ, ਅਸੀਂ 27 DLPFC ਸੰਸਥਾਵਾਂ ਤੋਂ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤ ਡੇਟਾ ਸੈਟ ਵਿੱਚ 44 ਮੋਡੀਊਲਾਂ ਦੀ ਸੰਭਾਲ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ। ਇਹਨਾਂ ਸੰਸਥਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਨਿਯੰਤਰਣ (n = 10), AsymAD (n = 8) ਅਤੇ AD (n = 9) ਕੇਸ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ ਏਡੀ ਦੇ ਨਮੂਨੇ ਸਾਡੇ ਖੋਜ ਬ੍ਰੇਨ ਕੋਹੋਰਟ (ਟੇਬਲ S1B) ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ, ਜਦੋਂ ਕਿ AsymAD ਕੇਸ ਸਿਰਫ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਵਿਲੱਖਣ ਸਨ. ਇਹ AsymAD ਕੇਸ ਵੀ Emory Goizueta ADRC ਬ੍ਰੇਨ ਬੈਂਕ ਤੋਂ ਆਏ ਸਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ ਮੌਤ ਦੇ ਸਮੇਂ ਬੋਧ ਆਮ ਸੀ, ਐਮੀਲੋਇਡ ਪੱਧਰ ਅਸਧਾਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਉੱਚੇ ਸਨ (ਮਤਲਬ CERAD, 2.8 ± 0.5) (ਸਾਰਣੀ S1B)।
ਇਹਨਾਂ 27 ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਦੇ TMT-MS ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਵਜੋਂ 11,244 ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਤੈਅ ਕੀਤੀ ਗਈ। ਇਸ ਅੰਤਿਮ ਗਿਣਤੀ ਵਿੱਚ ਘੱਟੋ-ਘੱਟ 50% ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ਼ ਉਹੀ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਇਸ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਵਿੱਚ ਸਾਡੇ ਖੋਜ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਖੋਜੇ ਗਏ 8817 ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ 8638 (98.0%) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਅਤੇ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ AD ਸਮੂਹਾਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਲਗਭਗ 3000 ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਦਲੇ ਗਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਹਨ (ਪੀ <0.05, ਪਰਿਵਰਤਨ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਟੂਕੀ ਦੇ ਪੇਅਰਡ ਟੀ ਟੈਸਟ ਤੋਂ ਬਾਅਦ) ( ਸਾਰਣੀ S2F)। ਇਹਨਾਂ ਵਿਭਿੰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਗਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ, 910 ਨੇ AD ਅਤੇ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਨਿਯੰਤਰਣ ਮਾਮਲਿਆਂ (P <0.05, ANOVA Tukey ਪੇਅਰਡ ਟੀ-ਟੈਸਟ ਤੋਂ ਬਾਅਦ) ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਪੱਧਰ ਦੇ ਬਦਲਾਅ ਵੀ ਦਿਖਾਏ। ਇਹ ਧਿਆਨ ਦੇਣ ਯੋਗ ਹੈ ਕਿ ਇਹ 910 ਮਾਰਕਰ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਜ਼ (r = 0.94, P <1.0 × 10-200) (ਚਿੱਤਰ S3A) ਵਿਚਕਾਰ ਤਬਦੀਲੀ ਦੀ ਦਿਸ਼ਾ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਇਕਸਾਰ ਹਨ। ਵਧੇ ਹੋਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚ, ਡੇਟਾ ਸੈੱਟਾਂ ਵਿੱਚ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਇਕਸਾਰ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਵਾਲੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੁੱਖ ਤੌਰ 'ਤੇ ਗਲੀਅਲ-ਅਮੀਰ M5 ਅਤੇ M18 ਮੋਡੀਊਲ (MDK, COL25A1, MAPT, NTN1, SMOC1, ਅਤੇ GFAP) ਦੇ ਮੈਂਬਰ ਹਨ। ਘਟਾਏ ਗਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚ, ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਇਕਸਾਰ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਵਾਲੇ ਲਗਭਗ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤੌਰ 'ਤੇ M1 ਮੋਡੀਊਲ (NPTX2, VGF, ਅਤੇ RPH3A) ਦੇ ਮੈਂਬਰ ਸਨੈਪਸ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਸਨ। ਅਸੀਂ ਪੱਛਮੀ ਬਲੋਟਿੰਗ (ਚਿੱਤਰ S3B) ਦੁਆਰਾ ਮਿਡਕਾਇਨ (MDK), CD44, ਫ੍ਰੀਜ਼ਲਡ-ਸਬੰਧਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ 1 (SFRP1) ਅਤੇ VGF ਦੀਆਂ AD-ਸੰਬੰਧੀ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੀ ਹੋਰ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕੀਤੀ। ਮੋਡੀਊਲ ਸੰਭਾਲ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਦਿਖਾਇਆ ਕਿ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ ਲਗਭਗ 80% ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਡੀਊਲ (34/44) ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ (z-score> 1.96, FDR ਠੀਕ ਕੀਤਾ P <0.05) (ਚਿੱਤਰ S3C) ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਸਨ। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਚੌਦਾਂ ਮੋਡੀਊਲ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤੌਰ 'ਤੇ ਦੋ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਰਾਖਵੇਂ ਸਨ (z-score> 10, FDR ਠੀਕ ਕੀਤਾ P <1.0 × 10−23)। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਅਤੇ ਮਾਡਯੂਲਰ ਰਚਨਾ ਵਿੱਚ ਉੱਚ ਪੱਧਰੀ ਇਕਸਾਰਤਾ ਦੀ ਖੋਜ ਅਤੇ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ AD ਫਰੰਟਲ ਕਾਰਟੈਕਸ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿੱਚ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੀ ਪ੍ਰਜਨਨ ਯੋਗਤਾ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਇਸ ਨੇ ਇਹ ਵੀ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕੀਤੀ ਕਿ AsymAD ਅਤੇ ਹੋਰ ਉੱਨਤ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਹੀ ਸਮਾਨ ਬ੍ਰੇਨ ਨੈਟਵਰਕ ਬਣਤਰ ਹੈ.
ਦਿਮਾਗ ਦੀ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਡੇਟਾ ਸੈਟ ਵਿੱਚ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਾ ਇੱਕ ਹੋਰ ਵਿਸਤ੍ਰਿਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ AsymAD ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੀ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਡਿਗਰੀ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ AsymAD ਅਤੇ ਨਿਯੰਤਰਣ (P <0.05) (ਚਿੱਤਰ S3D) ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਕੁੱਲ 151 ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਦਲੇ ਗਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਐਮੀਲੋਇਡ ਲੋਡ ਦੇ ਨਾਲ ਇਕਸਾਰ, ਅਸੀਮਏਡ ਅਤੇ ਏਡੀ ਦੇ ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਏਪੀਪੀ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਧਿਆ. MAPT ਸਿਰਫ AD ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਦਲਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਟੈਂਗਲਾਂ ਦੇ ਵਧੇ ਹੋਏ ਪੱਧਰਾਂ ਅਤੇ ਬੋਧਾਤਮਕ ਗਿਰਾਵਟ (5, 7) ਨਾਲ ਇਸਦੇ ਜਾਣੇ-ਪਛਾਣੇ ਸਬੰਧਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਇਕਸਾਰ ਹੈ। glial-ਅਮੀਰ ਮੋਡੀਊਲ (M5 ਅਤੇ M18) AsymAD ਵਿੱਚ ਵਧੇ ਹੋਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਪ੍ਰਤੀਬਿੰਬਿਤ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਨਿਊਰੋਨ-ਸਬੰਧਤ M1 ਮੋਡੀਊਲ AsymAD ਵਿੱਚ ਘਟੇ ਹੋਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਾ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਪ੍ਰਤੀਨਿਧ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ AsymAD ਮਾਰਕਰ ਲੱਛਣ ਰੋਗਾਂ ਵਿੱਚ ਵਧੇਰੇ ਬਦਲਾਅ ਦਿਖਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਮਾਰਕਰਾਂ ਵਿੱਚ SMOC1, M18 ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਇੱਕ ਗਲਾਈਅਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਹੈ, ਜੋ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਟਿਊਮਰ ਅਤੇ ਅੱਖਾਂ ਅਤੇ ਅੰਗਾਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ (32) ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਹੈ। MDK ਸੈੱਲ ਵਿਕਾਸ ਅਤੇ ਐਂਜੀਓਜੇਨੇਸਿਸ (33) ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹੈਪਰੀਨ-ਬਾਈਡਿੰਗ ਵਿਕਾਸ ਕਾਰਕ ਹੈ, ਜੋ M18 ਦਾ ਇੱਕ ਹੋਰ ਮੈਂਬਰ ਹੈ। ਨਿਯੰਤਰਣ ਸਮੂਹ ਦੇ ਨਾਲ ਤੁਲਨਾ ਵਿੱਚ, AsymAD ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਵਾਧਾ ਹੋਇਆ, ਜਿਸਦੇ ਬਾਅਦ AD ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਵੱਡਾ ਵਾਧਾ ਹੋਇਆ। ਇਸਦੇ ਉਲਟ, ਅਸੀਮਏਡੀ ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨਿਊਰੋਪੇਂਟ੍ਰੈਕਸਿਨ 2 (ਐਨਪੀਟੀਐਕਸ 2) ਨੂੰ ਕਾਫ਼ੀ ਘੱਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ. NPTX2 ਪਹਿਲਾਂ neurodegeneration ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਸੀ ਅਤੇ excitatory synapses (34) ਵਿੱਚ ਵਿਚੋਲਗੀ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮਾਨਤਾ ਪ੍ਰਾਪਤ ਭੂਮਿਕਾ ਹੈ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਨਤੀਜੇ AD ਵਿੱਚ ਵੱਖੋ-ਵੱਖਰੇ ਪੂਰਵ-ਕਲੀਨਿਕਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦੇ ਹਨ ਜੋ ਬਿਮਾਰੀ ਦੀ ਗੰਭੀਰਤਾ ਦੇ ਨਾਲ ਤਰੱਕੀ ਕਰਦੇ ਜਾਪਦੇ ਹਨ।
ਇਹ ਧਿਆਨ ਵਿੱਚ ਰੱਖਦੇ ਹੋਏ ਕਿ ਅਸੀਂ ਬ੍ਰੇਨ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਖੋਜ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਕਵਰੇਜ ਦੀ ਇੱਕ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਡੂੰਘਾਈ ਨੂੰ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤਾ ਹੈ, ਅਸੀਂ ਨੈੱਟਵਰਕ-ਪੱਧਰ ਦੇ AD ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮ ਦੇ ਨਾਲ ਇਸਦੇ ਓਵਰਲੈਪ ਨੂੰ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਸਮਝਣ ਦੀ ਕੋਸ਼ਿਸ਼ ਕਰ ਰਹੇ ਹਾਂ। ਇਸ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਬ੍ਰੇਨ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਉਸ ਮੋਡੀਊਲ ਨਾਲ ਕੀਤੀ ਜੋ ਅਸੀਂ ਪਹਿਲਾਂ AD (n = 308) ਅਤੇ ਕੰਟਰੋਲ (n = 157) DLPFC ਟਿਸ਼ੂਜ਼ (13) ਵਿੱਚ 18,204 ਜੀਨਾਂ ਦੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਏਰੇ ਮਾਪ ਤੋਂ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਸੀ। ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਅਸੀਂ 20 ਵੱਖ-ਵੱਖ ਆਰਐਨਏ ਮਾਡਿਊਲਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਕਈਆਂ ਨੇ ਖਾਸ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮਾਂ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਕੀਤਾ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਨਿਊਰੋਨਸ, ਓਲੀਗੋਡੈਂਡਰੋਸਾਈਟਸ, ਐਸਟ੍ਰੋਸਾਈਟਸ, ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਗਲੀਆ (ਚਿੱਤਰ 3A) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। AD ਵਿੱਚ ਇਹਨਾਂ ਮੋਡੀਊਲਾਂ ਦੇ ਕਈ ਬਦਲਾਅ ਚਿੱਤਰ 3B ਵਿੱਚ ਦਿਖਾਏ ਗਏ ਹਨ। ਡੂੰਘੇ ਅਨਲੇਬਲਡ ਐਮਐਸ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ (ਲਗਭਗ 3000 ਪ੍ਰੋਟੀਨ) (13) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਸਾਡੇ ਪਿਛਲੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ-ਆਰਐਨਏ ਓਵਰਲੈਪ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਨਾਲ ਇਕਸਾਰ, ਬ੍ਰੇਨ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਨੈਟਵਰਕ ਦੇ ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ 44 ਮੋਡੀਊਲ ਜੋ ਅਸੀਂ ਲੱਭੇ ਹਨ, ਟਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਨੈਟਵਰਕ ਵਿੱਚ ਵੀ ਕੋਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਓਵਰਲੈਪ ਨਹੀਂ ਹੈ। ਸਾਡੀ ਖੋਜ ਅਤੇ 34 ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮਾਡਿਊਲਾਂ ਦੀ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਜੋ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਬਰਕਰਾਰ ਹੈ, ਸਿਰਫ 14 (~ 40%) ਨੇ ਫਿਸ਼ਰ ਦੇ ਸਹੀ ਟੈਸਟ (FET) ਪਾਸ ਕੀਤਾ ਹੈ ਜੋ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮ (ਚਿੱਤਰ 3A) ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਅੰਕੜਾ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਓਵਰਲੈਪ ਸਾਬਤ ਹੋਇਆ ਹੈ। DNA ਡੈਮੇਜ ਰਿਪੇਅਰ (P-M25 ਅਤੇ P-M19), ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਟ੍ਰਾਂਸਲੇਸ਼ਨ (P-M7 ਅਤੇ P-M20), RNA ਬਾਈਡਿੰਗ/ਸਪਲਾਈਸਿੰਗ (P-M16 ਅਤੇ P-M21) ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਟਾਰਗੇਟਿੰਗ (P-M13 ਅਤੇ P-) ਦੇ ਅਨੁਕੂਲ। M23) ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਵਿੱਚ ਮੋਡੀਊਲਾਂ ਨਾਲ ਓਵਰਲੈਪ ਨਹੀਂ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਲਈ, ਹਾਲਾਂਕਿ ਮੌਜੂਦਾ ਓਵਰਲੈਪ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (13) ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਡੂੰਘੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ AD ਨੈੱਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਨੂੰ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਨੈਟਵਰਕ ਨਾਲ ਮੈਪ ਨਹੀਂ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
(ਏ) ਹਾਈਪਰਜੀਓਮੈਟ੍ਰਿਕ ਐਫਈਟੀ ਏਡੀ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮ (ਸਿਖਰ) ਦੇ ਆਰਐਨਏ ਮੋਡੀਊਲ ਵਿੱਚ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਅਤੇ ਏਡੀ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਆਰਐਨਏ (ਐਕਸ-ਐਕਸਿਸ) ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (ਵਾਈ-ਐਕਸਿਸ) ਮੋਡੀਊਲ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਓਵਰਲੈਪ ਦੀ ਡਿਗਰੀ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। (ਹੇਠਾਂ)। ਲਾਲ ਰੰਗਤ ਦੀ ਤੀਬਰਤਾ ਉੱਪਰਲੇ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮਾਂ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਦੀ ਡਿਗਰੀ ਅਤੇ ਹੇਠਲੇ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਮੋਡਿਊਲਾਂ ਦੇ ਓਵਰਲੈਪ ਦੀ ਤੀਬਰਤਾ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ। ਤਾਰੇ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਮਹੱਤਤਾ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ (ਪੀ <0.05). (ਬੀ) ਹਰੇਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਮੋਡੀਊਲ ਅਤੇ AD ਸਥਿਤੀ ਦੇ ਗੁਣਾਂ ਵਾਲੇ ਜੀਨਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧ ਦੀ ਡਿਗਰੀ। ਖੱਬੇ ਪਾਸੇ ਦੇ ਮੋਡੀਊਲ AD (ਨੀਲੇ) ਨਾਲ ਸਭ ਤੋਂ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਬੰਧਿਤ ਹਨ, ਅਤੇ ਸੱਜੇ ਪਾਸੇ ਵਾਲੇ AD (ਲਾਲ) ਨਾਲ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਬੰਧਿਤ ਹਨ। ਲੌਗ-ਪਰਿਵਰਤਿਤ BH- ਠੀਕ ਕੀਤਾ P ਮੁੱਲ ਹਰੇਕ ਸਬੰਧ ਦੇ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਮਹੱਤਵ ਦੀ ਡਿਗਰੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ। (C) ਸਾਂਝੇ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਦੇ ਨਾਲ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਮੋਡੀਊਲ। (D) ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਮੋਡੀਊਲ ਵਿੱਚ ਲੇਬਲ ਕੀਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (x-ਧੁਰਾ) ਅਤੇ RNA (y-ਧੁਰਾ) ਦੇ ਲੌਗ2 ਫੋਲਡ ਬਦਲਾਅ ਦਾ ਸਬੰਧ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ। ਸੰਬੰਧਿਤ P ਮੁੱਲ ਦੇ ਨਾਲ ਪੀਅਰਸਨ ਸਹਿ-ਸੰਬੰਧ ਗੁਣਾਂਕ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। ਮਾਈਕਰੋ, ਮਾਈਕ੍ਰੋਗਲੀਆ; ਆਕਾਸ਼ੀ ਸਰੀਰ, ਐਸਟ੍ਰੋਸਾਈਟਸ। ਸੀਟੀ, ਕੰਟਰੋਲ.
ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਤੇ ਆਰਐਨਏ ਮੋਡੀਊਲ ਸਮਾਨ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ ਅਤੇ ਇਕਸਾਰ AD ਤਬਦੀਲੀ ਦਿਸ਼ਾਵਾਂ (ਚਿੱਤਰ 3, B ਅਤੇ C) ਨੂੰ ਸਾਂਝਾ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਦੂਜੇ ਸ਼ਬਦਾਂ ਵਿੱਚ, ਦਿਮਾਗ਼ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ (PM′1) ਦੇ ਸਿੰਨੈਪਸ-ਸਬੰਧਤ M1 ਮੋਡੀਊਲ ਨੂੰ ਤਿੰਨ ਨਿਊਰੋਨਲ-ਅਮੀਰ ਹੋਮੋਲੋਗਸ ਆਰਐਨਏ ਮੋਡੀਊਲ (R-M1, R-M9 ਅਤੇ R-M16) ਨਾਲ ਮੈਪ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ AD ਵਿੱਚ ਦੋਵਾਂ ਨੂੰ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ। ਇੱਕ ਘਟਿਆ ਪੱਧਰ. ਇਸੇ ਤਰ੍ਹਾਂ, ਗਲੀਅਲ-ਅਮੀਰ M5 ਅਤੇ M18 ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਡੀਊਲ ਐਸਟ੍ਰੋਸਾਈਟਸ ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਗਲੀਏਲ ਮਾਰਕਰ (R-M3, R-M7, ਅਤੇ R-M10) ਨਾਲ ਭਰਪੂਰ RNA ਮੋਡੀਊਲ ਨਾਲ ਓਵਰਲੈਪ ਕਰਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਵਾਧਾ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਦੋ ਡਾਟਾ ਸੈੱਟਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਇਹ ਸਾਂਝੀਆਂ ਮਾਡਯੂਲਰ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ ਦੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਅਤੇ ਰੋਗ-ਸਬੰਧਤ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਦੀਆਂ ਹਨ ਜੋ ਅਸੀਂ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ ਵੇਖੀਆਂ ਹਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਅਸੀਂ ਇਹਨਾਂ ਸਾਂਝੇ ਮੋਡੀਊਲਾਂ ਵਿੱਚ RNA ਅਤੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਪੱਧਰਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਅੰਤਰ ਵੇਖੇ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਮਾਡਿਊਲਾਂ (ਚਿੱਤਰ 3D) ਦੇ ਅੰਦਰਲੇ ਅਣੂਆਂ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਅਤੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ ਦੇ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਾ ਸਬੰਧ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਇਸ ਅਸੰਗਤਤਾ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, APP ਅਤੇ ਕਈ ਹੋਰ ਗਲਾਈਅਲ ਮੋਡੀਊਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (NTN1, MDK, COL25A1, ICAM1, ਅਤੇ SFRP1) ਨੇ AD ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਵਾਧਾ ਦਿਖਾਇਆ, ਪਰ AD ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਵਿੱਚ ਲਗਭਗ ਕੋਈ ਬਦਲਾਅ ਨਹੀਂ ਹੋਇਆ। ਇਹ ਪ੍ਰੋਟੀਨ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਐਮੀਲੋਇਡ ਪਲੇਕਸ (23, 35) ਨਾਲ ਨੇੜਿਓਂ ਸਬੰਧਤ ਹੋ ਸਕਦੀਆਂ ਹਨ, ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਨੂੰ ਪੈਥੋਲੋਜੀਕਲ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੇ ਸਰੋਤ ਵਜੋਂ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦੀਆਂ ਹਨ, ਅਤੇ ਇਹ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਤੀਬਿੰਬਿਤ ਨਹੀਂ ਹੋ ਸਕਦੀਆਂ ਹਨ।
ਸਾਡੇ ਦੁਆਰਾ ਖੋਜੇ ਗਏ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਜ਼ ਦਾ ਸੁਤੰਤਰ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਅਸੀਂ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਨੈਟਵਰਕ ਦੇ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ AD CSF ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਲਈ ਦੋ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟਾਂ ਦਾ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ। ਸਾਨੂੰ ਪਹਿਲਾਂ ਦੋ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਓਵਰਲੈਪ ਨੂੰ ਪਰਿਭਾਸ਼ਿਤ ਕਰਨਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ। ਹਾਲਾਂਕਿ ਇਹ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਵੀਕਾਰ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਕਿ CSF AD ਦਿਮਾਗ (4) ਵਿੱਚ ਨਿਊਰੋਕੈਮੀਕਲ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ, AD ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਓਵਰਲੈਪ ਦੀ ਸਹੀ ਡਿਗਰੀ ਅਸਪਸ਼ਟ ਹੈ। ਸਾਡੇ ਦੋ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ ਖੋਜੇ ਗਏ ਸਾਂਝੇ ਜੀਨ ਉਤਪਾਦਾਂ ਦੀ ਸੰਖਿਆ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕਰਕੇ, ਅਸੀਂ ਪਾਇਆ ਕਿ ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਪਛਾਣੇ ਗਏ ਲਗਭਗ 70% (n = 1936) ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਵੀ ਮਾਪਿਆ ਗਿਆ ਸੀ (ਚਿੱਤਰ 4A)। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਬਹੁਤੇ ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (n = 1721) ਖੋਜ ਬ੍ਰੇਨ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ (ਚਿੱਤਰ 4B) ਤੋਂ 44 ਸਹਿ-ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਮਾਡਿਊਲਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਇੱਕ ਨਾਲ ਮੈਪ ਕੀਤੇ ਗਏ ਹਨ। ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਉਮੀਦ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ, ਛੇ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਡੇ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਮੋਡੀਊਲ (M1 ਤੋਂ M6) ਨੇ CSF ਓਵਰਲੈਪ ਦੀ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਡੀ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਕੀਤਾ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਇੱਥੇ ਛੋਟੇ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਮੋਡੀਊਲ ਹਨ (ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, M15 ਅਤੇ M29) ਜੋ ਅਚਾਨਕ ਉੱਚ ਪੱਧਰ ਦੇ ਓਵਰਲੈਪ ਨੂੰ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਮੋਡੀਊਲ ਦੇ ਆਕਾਰ ਤੋਂ ਦੁੱਗਣਾ ਵੱਡਾ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਸਾਨੂੰ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਓਵਰਲੈਪ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਵਧੇਰੇ ਵਿਸਤ੍ਰਿਤ, ਅੰਕੜਾ ਸੰਚਾਲਿਤ ਵਿਧੀ ਅਪਣਾਉਣ ਲਈ ਪ੍ਰੇਰਿਤ ਕਰਦਾ ਹੈ।
(A ਅਤੇ B) ਖੋਜ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ CSF ਡੇਟਾ ਸੈੱਟਾਂ ਵਿੱਚ ਖੋਜੇ ਗਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਓਵਰਲੈਪ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਬਹੁਤੇ ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਸਹਿ-ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਨੈਟਵਰਕ ਦੇ 44 ਸਹਿ-ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਮਾਡਿਊਲਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਇੱਕ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਹਨ। (C) ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਅਤੇ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਨੈਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਓਵਰਲੈਪ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰੋ। ਹੀਟ ਮੈਪ ਦੀ ਹਰ ਕਤਾਰ ਹਾਈਪਰਜੀਓਮੈਟ੍ਰਿਕ FET ਦੇ ਇੱਕ ਵੱਖਰੇ ਓਵਰਲੈਪ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ। ਸਿਖਰ ਦੀ ਕਤਾਰ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਮੋਡੀਊਲ ਅਤੇ ਪੂਰੇ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਓਵਰਲੈਪ (ਸਲੇਟੀ/ਕਾਲਾ ਰੰਗਤ) ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ। ਦੂਜੀ ਲਾਈਨ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ ਕਿ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਮੋਡੀਊਲ ਅਤੇ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨ (ਲਾਲ ਵਿੱਚ ਰੰਗਤ) ਵਿਚਕਾਰ ਓਵਰਲੈਪ AD (P <0.05) ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਹੈ। ਤੀਜੀ ਕਤਾਰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ ਕਿ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਮੋਡੀਊਲ ਅਤੇ ਸੀਐਸਐਫ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (ਨੀਲੀ ਰੰਗਤ) ਵਿਚਕਾਰ ਓਵਰਲੈਪ AD (ਪੀ <0.05) ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਹੇਠਾਂ-ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਹੈ। FET ਤੋਂ ਪ੍ਰਾਪਤ P ਮੁੱਲ ਨੂੰ ਠੀਕ ਕਰਨ ਲਈ BH ਵਿਧੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰੋ। (ਡੀ) ਫੋਲਡਿੰਗ ਮੋਡੀਊਲ ਪੈਨਲ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਅਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ GO ਨਿਯਮਾਂ 'ਤੇ ਆਧਾਰਿਤ ਹੈ। ਇਹਨਾਂ ਪੈਨਲਾਂ ਵਿੱਚ ਕੁੱਲ 271 ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਜੋ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ ਅਰਥਪੂਰਨ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਰੱਖਦੇ ਹਨ।
ਸਿੰਗਲ-ਟੇਲਡ FETs ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, ਅਸੀਂ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਅਤੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਮੋਡੀਊਲ ਵਿਚਕਾਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਓਵਰਲੈਪ ਦੇ ਮਹੱਤਵ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕੀਤਾ। ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਤੋਂ ਪਤਾ ਲੱਗਿਆ ਹੈ ਕਿ CSF ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਵਿੱਚ ਕੁੱਲ 14 ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਮੋਡਿਊਲਾਂ ਵਿੱਚ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਓਵਰਲੈਪ ਹਨ (FDR ਐਡਜਸਟਡ P <0.05), ਅਤੇ ਇੱਕ ਵਾਧੂ ਮੋਡੀਊਲ (M18) ਜਿਸਦਾ ਓਵਰਲੈਪ ਮਹੱਤਵ ਦੇ ਨੇੜੇ ਹੈ (FDR ਐਡਜਸਟਡ P = 0.06) (ਚਿੱਤਰ 4C) , ਸਿਖਰਲੀ ਕਤਾਰ)। ਅਸੀਂ ਉਹਨਾਂ ਮੌਡਿਊਲਾਂ ਵਿੱਚ ਵੀ ਦਿਲਚਸਪੀ ਰੱਖਦੇ ਹਾਂ ਜੋ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਨਾਲ ਜ਼ੋਰਦਾਰ ਢੰਗ ਨਾਲ ਓਵਰਲੈਪ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਇਸ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਇਹ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਨ ਲਈ ਦੋ ਵਾਧੂ FET ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਨੂੰ ਲਾਗੂ ਕੀਤਾ ਕਿ (i) CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨ AD ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਧਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ ਅਤੇ (ii) CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੂੰ AD ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਘਟਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ (P <0.05, ਪੇਅਰਡ ਟੀ ਟੈਸਟ AD/ਕੰਟਰੋਲ) ਅਰਥਪੂਰਨ ਓਵਰਲੈਪ ਦੇ ਨਾਲ ਬ੍ਰੇਨ ਮੋਡਿਊਲ ਉਹਨਾਂ ਵਿਚਕਾਰ। ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਚਿੱਤਰ 4C ਦੀਆਂ ਮੱਧ ਅਤੇ ਹੇਠਲੀਆਂ ਕਤਾਰਾਂ ਵਿੱਚ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ, ਇਹ ਵਾਧੂ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ 44 ਵਿੱਚੋਂ 8 ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਮੋਡੀਊਲ AD CSF (M12, M1, M2, M18, M5, M44, M33, ਅਤੇ M38) ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨਾਲ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਓਵਰਲੈਪ ਕਰਦੇ ਹਨ। . ), ਜਦੋਂ ਕਿ ਸਿਰਫ ਦੋ ਮੋਡੀਊਲ (M6 ਅਤੇ M15) ਨੇ AD CSF ਵਿੱਚ ਘਟੇ ਹੋਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਅਰਥਪੂਰਨ ਓਵਰਲੈਪ ਦਿਖਾਇਆ। ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਉਮੀਦ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਸਾਰੇ 10 ਮੋਡੀਊਲ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਨਾਲ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਓਵਰਲੈਪ ਵਾਲੇ 15 ਮੋਡੀਊਲਾਂ ਵਿੱਚ ਹਨ। ਇਸ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਇਹ ਮੰਨਦੇ ਹਾਂ ਕਿ ਇਹ 15 ਮੋਡੀਊਲ AD ਦਿਮਾਗ ਤੋਂ ਪ੍ਰਾਪਤ CSF ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਉੱਚ-ਉਪਜ ਸਰੋਤ ਹਨ।
ਅਸੀਂ ਇਹਨਾਂ 15 ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਮੋਡੀਊਲਾਂ ਨੂੰ ਡਬਲਯੂਜੀਸੀਐਨਏ ਟ੍ਰੀ ਡਾਇਗ੍ਰਾਮ ਵਿੱਚ ਉਹਨਾਂ ਦੀ ਨੇੜਤਾ ਅਤੇ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮਾਂ ਅਤੇ ਜੀਨ ਔਨਟੋਲੋਜੀ (ਚਿੱਤਰ 4D) ਨਾਲ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਸਬੰਧ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਪੰਜ ਵੱਡੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਪੈਨਲਾਂ ਵਿੱਚ ਫੋਲਡ ਕੀਤਾ ਹੈ। ਪਹਿਲੇ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਨਿਊਰੋਨ ਮਾਰਕਰ ਅਤੇ ਸਿਨੈਪਸ-ਸਬੰਧਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (M1 ਅਤੇ M12) ਨਾਲ ਭਰਪੂਰ ਮੋਡੀਊਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਕੁੱਲ 94 ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਅਤੇ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ ਪੱਧਰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਦਲ ਗਏ ਹਨ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਇਹ ਪੰਜ ਪੈਨਲਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ CSF ਮਾਰਕਰਾਂ ਦਾ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਡਾ ਸਰੋਤ ਬਣ ਗਿਆ ਹੈ। ਦੂਜੇ ਸਮੂਹ (M6 ਅਤੇ M15) ਨੇ ਐਂਡੋਥੈਲੀਅਲ ਸੈੱਲ ਮਾਰਕਰਾਂ ਅਤੇ ਨਾੜੀ ਸਰੀਰ ਦੇ ਨਾਲ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਸਬੰਧ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਕੀਤਾ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ "ਜ਼ਖ਼ਮ ਭਰਨ" (M6) ਅਤੇ "ਹਿਊਮੋਰਲ ਇਮਿਊਨ ਪ੍ਰਤੀਕਿਰਿਆ ਦਾ ਨਿਯਮ" (M15)। M15 ਲਿਪੋਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ ਨਾਲ ਵੀ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਸੰਬੰਧਿਤ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਐਂਡੋਥੈਲਿਅਮ (36) ਨਾਲ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਸਬੰਧ ਰੱਖਦਾ ਹੈ। ਨਾੜੀ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ 34 CSF ਮਾਰਕਰ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਤੀਜੇ ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਮੌਡਿਊਲ (M2 ਅਤੇ M4) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ ਜੋ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ oligodendrocyte ਮਾਰਕਰਾਂ ਅਤੇ ਸੈੱਲ ਪ੍ਰਸਾਰ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹਨ। ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, M2 ਦੇ ਉੱਚ-ਪੱਧਰੀ ਔਨਟੋਲੋਜੀ ਸ਼ਬਦਾਂ ਵਿੱਚ "ਡੀਐਨਏ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਦਾ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਨਿਯਮ" ਅਤੇ "ਪਿਊਰੀਨ ਬਾਇਓਸਿੰਥੇਸਿਸ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ" ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਇਸ ਦੌਰਾਨ, M4 ਦੇ ਉਹਨਾਂ ਵਿੱਚ "ਗਲੀਅਲ ਸੈੱਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ" ਅਤੇ "ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਅਲੱਗ-ਥਲੱਗ" ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਮਾਈਲਿਨੇਸ਼ਨ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ 49 CSF ਮਾਰਕਰ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।
ਚੌਥੇ ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਮੋਡੀਊਲ (M30, M29, M18, M24, ਅਤੇ M5) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਅਤੇ ਲਗਭਗ ਸਾਰੇ ਮੋਡੀਊਲ ਮਾਈਕ੍ਰੋਗਲੀਆ ਅਤੇ ਐਸਟ੍ਰੋਸਾਈਟ ਮਾਰਕਰਾਂ ਵਿੱਚ ਕਾਫ਼ੀ ਅਮੀਰ ਹਨ। ਮਾਈਲੀਨੇਸ਼ਨ ਪੈਨਲ ਵਾਂਗ, ਚੌਥੇ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਵੀ ਮੋਡਿਊਲ (M30, M29, ਅਤੇ M18) ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਜੋ ਸੈੱਲ ਦੇ ਪ੍ਰਸਾਰ ਨਾਲ ਨੇੜਿਓਂ ਸਬੰਧਤ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਇਸ ਸਮੂਹ ਦੇ ਦੂਜੇ ਮੋਡੀਊਲ ਇਮਿਊਨਲੋਜੀਕਲ ਸ਼ਬਦਾਂ ਨਾਲ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਸਬੰਧਤ ਹਨ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ "ਇਮਿਊਨ ਇਮਿਊਨ ਪ੍ਰਭਾਵ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ" (M5) ਅਤੇ "ਇਮਿਊਨ ਰਿਸਪਾਂਸ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ" (M24)। ਗਲਾਈਲ ਇਮਿਊਨ ਗਰੁੱਪ ਵਿੱਚ ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ 42 CSF ਮਾਰਕਰ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਅੰਤ ਵਿੱਚ, ਆਖਰੀ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਚਾਰ ਮਾਡਿਊਲਾਂ (M44, M3, M33, ਅਤੇ M38) 'ਤੇ ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ 52 ਮਾਰਕਰ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਇਹ ਸਾਰੇ ਊਰਜਾ ਸਟੋਰੇਜ ਅਤੇ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਸਰੀਰ 'ਤੇ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਡਾ ਮੋਡੀਊਲ (M3) ਮਾਈਟੋਕੌਂਡਰੀਆ ਨਾਲ ਨੇੜਿਓਂ ਸਬੰਧਤ ਹੈ ਅਤੇ ਨਿਊਰੋਨ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਮਾਰਕਰਾਂ ਨਾਲ ਭਰਪੂਰ ਹੈ। M38 ਇਸ ਮੈਟਾਬੋਲੋਮ ਵਿੱਚ ਛੋਟੇ ਮੋਡੀਊਲ ਮੈਂਬਰਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਇੱਕ ਹੈ ਅਤੇ ਮੱਧਮ ਨਿਊਰੋਨ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਵੀ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਪੰਜ ਪੈਨਲ AD ਕਾਰਟੈਕਸ ਵਿੱਚ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮਾਂ ਅਤੇ ਕਾਰਜਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਵਿਸ਼ਾਲ ਸ਼੍ਰੇਣੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਅਤੇ ਸਮੂਹਿਕ ਤੌਰ 'ਤੇ 271 ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ CSF ਮਾਰਕਰ (ਟੇਬਲ S2G) ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ MS ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੀ ਵੈਧਤਾ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਨ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਨੇੜਤਾ ਐਕਸਟੈਂਸ਼ਨ ਅਸੇ (PEA), ਮਲਟੀਪਲੈਕਸਿੰਗ ਸਮਰੱਥਾਵਾਂ, ਉੱਚ ਸੰਵੇਦਨਸ਼ੀਲਤਾ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਆਰਥੋਗੋਨਲ ਐਂਟੀਬਾਡੀ-ਆਧਾਰਿਤ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ, ਅਤੇ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦਾ ਮੁੜ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ ਜੋ ਸਾਨੂੰ ਇਹਨਾਂ 271 ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦਾ ਇੱਕ ਸਬਸੈੱਟ ਮਿਲਿਆ। (n = 36)। ਇਹ 36 ਟੀਚੇ PEA ਦੇ AD ਮਲਟੀਪਲ ਵਿੱਚ ਤਬਦੀਲੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਜੋ ਕਿ ਸਾਡੇ MS-ਅਧਾਰਿਤ ਖੋਜਾਂ (r = 0.87, P = 5.6 × 10-12) ਨਾਲ ਨੇੜਿਓਂ ਸਬੰਧਤ ਹੈ, ਜੋ ਸਾਡੇ ਵਿਆਪਕ MS ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (ਚਿੱਤਰ S4) ਦੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੀ ਜ਼ੋਰਦਾਰ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕਰਦੇ ਹਨ। ).
ਸਾਡੇ ਪੰਜ ਸਮੂਹਾਂ ਦੁਆਰਾ ਜ਼ੋਰ ਦਿੱਤਾ ਗਿਆ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਥੀਮ, ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਸਿਗਨਲ ਤੋਂ ਊਰਜਾ ਪਾਚਕ ਕਿਰਿਆ ਤੱਕ, ਸਾਰੇ AD (1-3) ਦੇ ਰੋਗਾਣੂ-ਵਿਗਿਆਨ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹਨ। ਇਸ ਲਈ, ਇਹਨਾਂ ਪੈਨਲਾਂ ਵਾਲੇ ਸਾਰੇ 15 ਮੋਡੀਊਲ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ AD ਪੈਥੋਲੋਜੀ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹਨ ਜੋ ਅਸੀਂ ਖੋਜਿਆ ਹੈ (ਚਿੱਤਰ 2B)। ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਧਿਆਨ ਦੇਣ ਯੋਗ ਹੈ ਸਾਡੇ ਗਲਾਈਅਲ ਮੋਡੀਊਲ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਉੱਚ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਪੈਥੋਲੋਜੀਕਲ ਸਬੰਧ ਅਤੇ ਸਾਡੇ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਡੇ ਨਿਊਰੋਨਲ ਮੋਡੀਊਲ (M1 ਅਤੇ M3) ਵਿਚਕਾਰ ਮਜ਼ਬੂਤ ਨੈਗੇਟਿਵ ਪੈਥੋਲੋਜੀਕਲ ਸਬੰਧ। ਸਾਡੇ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤ ਬ੍ਰੇਨ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ (ਚਿੱਤਰ S3D) ਦਾ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ M5 ਅਤੇ M18-ਪ੍ਰਾਪਤ ਗਲਿਅਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੂੰ ਵੀ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦਾ ਹੈ। AsymAD ਅਤੇ ਲੱਛਣ AD ਵਿੱਚ, ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਵਧੇ ਹੋਏ glial ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਤੇ M1-ਸਬੰਧਤ ਸਿਨੇਪਸ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੂੰ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਘਟਾਇਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਨਿਰੀਖਣ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ ਅਸੀਂ ਪੰਜ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਪਛਾਣੇ ਗਏ 271 ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਮਾਰਕਰ AD ਕਾਰਟੈਕਸ ਵਿੱਚ ਰੋਗ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹਨ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਉਹ ਵੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ ਜੋ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਅਸੈਂਪਟੋਮੈਟਿਕ ਪੜਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਵਾਪਰਦੀਆਂ ਹਨ।
ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਰੀੜ੍ਹ ਦੀ ਹੱਡੀ ਵਿੱਚ ਪੈਨਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਦਿਸ਼ਾ ਬਦਲਣ ਦਾ ਬਿਹਤਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ, ਅਸੀਂ 15 ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਮੋਡੀਊਲਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਹਰੇਕ ਲਈ ਹੇਠਾਂ ਦਿੱਤੇ ਹਨ: (i) ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਵਿੱਚ ਮੋਡੀਊਲ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦਾ ਪੱਧਰ ਲੱਭਿਆ ਅਤੇ (ii) ਮੋਡੀਊਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅੰਤਰ ਦਿਮਾਗ਼ੀ ਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ (ਚਿੱਤਰ S5) ਵਿੱਚ ਦਰਸਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ। ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਪਹਿਲਾਂ ਦੱਸਿਆ ਗਿਆ ਹੈ, WGCNA ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਮੋਡੀਊਲ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਜਾਂ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੁੱਲ ਨੂੰ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਨ ਲਈ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ (13). ਜੁਆਲਾਮੁਖੀ ਦੇ ਨਕਸ਼ੇ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ (AD/ਨਿਯੰਤਰਣ) ਵਿੱਚ ਮਾਡਿਊਲਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਾ ਵਰਣਨ ਕਰਨ ਲਈ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਅੰਕੜੇ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ ਪੰਜ ਪੈਨਲਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਤਿੰਨ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਰੀੜ੍ਹ ਦੀ ਹੱਡੀ ਵਿੱਚ ਵੱਖੋ-ਵੱਖਰੇ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਦੇ ਰੁਝਾਨਾਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਸਿਨੈਪਸ ਪੈਨਲ (M1 ਅਤੇ M12) ਦੇ ਦੋ ਮੋਡੀਊਲ AD ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੇ ਪੱਧਰ ਵਿੱਚ ਕਮੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਪਰ AD CSF (ਚਿੱਤਰ S5A) ਵਿੱਚ ਵਧੇ ਹੋਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਨਾਲ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਓਵਰਲੈਪ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਮੈਟਾਬੋਲੋਮ (M3 ਅਤੇ M38) ਵਾਲੇ ਨਿਊਰੋਨ-ਸਬੰਧਤ ਮੋਡੀਊਲ ਨੇ ਸਮਾਨ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਸਮੀਕਰਨ ਪੈਟਰਨ ਨੂੰ ਅਸੰਗਤ ਦਿਖਾਇਆ (ਚਿੱਤਰ S5E)। ਵੈਸਕੁਲਰ ਪੈਨਲ ਨੇ ਵੱਖੋ-ਵੱਖਰੇ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਦੇ ਰੁਝਾਨਾਂ ਨੂੰ ਵੀ ਦਿਖਾਇਆ, ਹਾਲਾਂਕਿ ਇਸਦੇ ਮੋਡਿਊਲ (M6 ਅਤੇ M15) ਨੂੰ AD ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਔਸਤਨ ਵਧਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰ CSF (ਚਿੱਤਰ S5B) ਵਿੱਚ ਘਟਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਬਾਕੀ ਬਚੇ ਦੋ ਪੈਨਲਾਂ ਵਿੱਚ ਵੱਡੇ ਗਲਾਈਲ ਨੈਟਵਰਕ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੋਵਾਂ ਕੰਪਾਰਟਮੈਂਟਾਂ (ਚਿੱਤਰ S5, C ਅਤੇ D) ਵਿੱਚ ਲਗਾਤਾਰ ਉੱਪਰ-ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।
ਕਿਰਪਾ ਕਰਕੇ ਨੋਟ ਕਰੋ ਕਿ ਇਹ ਰੁਝਾਨ ਇਹਨਾਂ ਪੈਨਲਾਂ ਦੇ ਸਾਰੇ ਮਾਰਕਰਾਂ ਲਈ ਆਮ ਨਹੀਂ ਹਨ। ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਕਈ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਜੋ AD ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ CSF (ਚਿੱਤਰ S5A) ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਘਟਾਏ ਜਾਂਦੇ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਡਾਊਨ-ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਮਾਰਕਰਾਂ ਵਿੱਚ M1 ਦਾ NPTX2 ਅਤੇ VGF, ਅਤੇ M12 ਦਾ ਕ੍ਰੋਮੋਗ੍ਰੈਨਿਨ ਬੀ ਹਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਇਹਨਾਂ ਅਪਵਾਦਾਂ ਦੇ ਬਾਵਜੂਦ, ਸਾਡੇ ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਮਾਰਕਰ AD ਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਵਿੱਚ ਉੱਚੇ ਹੁੰਦੇ ਹਨ. ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸਾਡੇ ਪੰਜ ਪੈਨਲਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਹਰੇਕ ਵਿੱਚ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਪੱਧਰਾਂ ਵਿੱਚ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਰੁਝਾਨਾਂ ਨੂੰ ਵੱਖ ਕਰਨ ਦੇ ਯੋਗ ਸਨ। ਇਹ ਰੁਝਾਨ AD ਵਿੱਚ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿਚਕਾਰ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਅਤੇ ਅਕਸਰ ਵੱਖਰੇ ਸਬੰਧਾਂ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦੇ ਹਨ।
ਫਿਰ, ਅਸੀਂ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਸਾਡੇ 271 ਸੈੱਟਾਂ ਨੂੰ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਹੋਨਹਾਰ ਅਤੇ ਪ੍ਰਜਨਨ ਯੋਗ ਟੀਚਿਆਂ (ਚਿੱਤਰ 5A) ਤੱਕ ਸੀਮਤ ਕਰਨ ਲਈ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ MS ਰੀਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ 1) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ। CSF ਕਾਪੀ 1 ਵਿੱਚ Emory Goizueta ADRC ਤੋਂ ਕੁੱਲ 96 ਨਮੂਨੇ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਕੰਟਰੋਲ, AsymAD, ਅਤੇ AD cohort (ਸਾਰਣੀ S1A) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਇਹ AD ਕੇਸ ਹਲਕੇ ਬੋਧਾਤਮਕ ਗਿਰਾਵਟ (ਮਤਲਬ MoCA, 20.0 ± 3.8), ਅਤੇ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ (ਟੇਬਲ S1A) ਵਿੱਚ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕੀਤੇ AD ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਵਿੱਚ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੁਆਰਾ ਦਰਸਾਏ ਗਏ ਹਨ। ਸਾਡੇ ਦੁਆਰਾ ਪਾਏ ਗਏ CSF ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਉਲਟ, ਇਹ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਇੱਕ ਵਧੇਰੇ ਕੁਸ਼ਲ ਅਤੇ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ "ਸਿੰਗਲ-ਸ਼ਾਟ" MS ਵਿਧੀ (ਆਫ-ਲਾਈਨ ਫਰੈਕਸ਼ਨੇਸ਼ਨ ਤੋਂ ਬਿਨਾਂ) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਸਰਲ ਨਮੂਨਾ ਤਿਆਰ ਕਰਨ ਵਾਲਾ ਪ੍ਰੋਟੋਕੋਲ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ ਜੋ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਇਮਯੂਨੋਡੀਪਲੇਸ਼ਨ ਦੀ ਜ਼ਰੂਰਤ ਨੂੰ ਖਤਮ ਕਰਦਾ ਹੈ। . ਇਸ ਦੀ ਬਜਾਏ, ਘੱਟ ਭਰਪੂਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (37) ਦੇ ਸਿਗਨਲ ਨੂੰ ਵਧਾਉਣ ਲਈ ਇੱਕ ਸਿੰਗਲ ਇਮਿਊਨ-ਡੈਪਲੀਟਿਡ "ਇਨਹਾਂਸਮੈਂਟ ਚੈਨਲ" ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ। ਹਾਲਾਂਕਿ ਇਹ ਕੁੱਲ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਕਵਰੇਜ ਨੂੰ ਘਟਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਇਹ ਸਿੰਗਲ-ਸ਼ਾਟ ਵਿਧੀ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮਸ਼ੀਨ ਦੇ ਸਮੇਂ ਨੂੰ ਘਟਾਉਂਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਟੀਐਮਟੀ-ਲੇਬਲ ਵਾਲੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਨੂੰ ਵਧਾਉਂਦੀ ਹੈ ਜੋ ਵਿਹਾਰਕ (17, 38) ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ 6,487 ਪੇਪਟਾਇਡਸ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ, ਜੋ ਕਿ 96 ਮਾਮਲਿਆਂ ਵਿੱਚ 1,183 ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਨੂੰ ਮੈਪ ਕੀਤਾ ਗਿਆ। ਜਿਵੇਂ ਕਿ CSF ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਨਾਲ ਅਸੀਂ ਪਾਇਆ ਹੈ, ਸਿਰਫ ਉਹ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਜੋ ਘੱਟੋ-ਘੱਟ 50% ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਮਾਪਦੇ ਹਨ, ਨੂੰ ਬਾਅਦ ਦੀਆਂ ਗਣਨਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ, ਅਤੇ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਉਮਰ ਅਤੇ ਲਿੰਗ ਦੇ ਪ੍ਰਭਾਵਾਂ ਲਈ ਵਾਪਸ ਲਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਇਸ ਨਾਲ 792 ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਜ਼ ਦੀ ਅੰਤਿਮ ਮਾਤਰਾ ਤੈਅ ਕੀਤੀ ਗਈ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਵਿੱਚੋਂ 95% ਦੀ ਪਛਾਣ CSF ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਵਿੱਚ ਵੀ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ।
(ਏ) ਬ੍ਰੇਨ-ਸਬੰਧਤ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਟੀਚਿਆਂ ਨੂੰ ਪਹਿਲੇ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤ CSF ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ ਅਤੇ ਅੰਤਮ ਪੈਨਲ (n = 60) ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। (B ਤੋਂ E) ਪੈਨਲ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਪੱਧਰ (ਕੰਪੋਜ਼ਿਟ z-ਸਕੋਰ) ਚਾਰ CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਮਾਪੇ ਗਏ। ਪੇਅਰਡ ਟੀ-ਟੈਸਟਾਂ ਜਾਂ ਟੂਕੇ ਦੇ ਪੋਸਟ-ਕੁਰੈਕਸ਼ਨ ਦੇ ਨਾਲ ਐਨੋਵਾ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਹਰੇਕ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਭਰਪੂਰਤਾ ਵਿੱਚ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੇ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਮਹੱਤਵ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਨ ਲਈ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ। ਸੀਟੀ, ਕੰਟਰੋਲ.
ਕਿਉਂਕਿ ਅਸੀਂ ਵਿਸਤ੍ਰਿਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੁਆਰਾ ਸਾਡੇ 271 ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ CSF ਟੀਚਿਆਂ ਦੀ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤੌਰ 'ਤੇ ਦਿਲਚਸਪੀ ਰੱਖਦੇ ਹਾਂ, ਅਸੀਂ ਇਸ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਹੋਰ ਜਾਂਚ ਨੂੰ ਇਹਨਾਂ ਮਾਰਕਰਾਂ ਤੱਕ ਸੀਮਤ ਕਰਾਂਗੇ। ਇਹਨਾਂ 271 ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ, 100 ਨੂੰ CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ 1 ਵਿੱਚ ਖੋਜਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਚਿੱਤਰ S6A ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ AD ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਦੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਇਹਨਾਂ 100 ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਿਖਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਅਤੇ ਮੈਟਾਬੋਲਾਈਟ ਹਿਸਟੋਨ AD ਵਿੱਚ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਵਧਦੇ ਹਨ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਨਾੜੀ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਬਿਮਾਰੀ ਵਿੱਚ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਘਟਦੇ ਹਨ। ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ 100 ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਮਾਰਕਰ (n = 70) ਨੇ ਦੋ ਡਾਟਾ ਸੈੱਟਾਂ (ਚਿੱਤਰ S6B) ਵਿੱਚ ਤਬਦੀਲੀ ਦੀ ਇੱਕੋ ਦਿਸ਼ਾ ਬਣਾਈ ਰੱਖੀ। ਇਹ 70 ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਦਿਮਾਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ CSF ਮਾਰਕਰ (ਟੇਬਲ S2H) ਵੱਡੇ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਪਹਿਲਾਂ ਦੇਖੇ ਗਏ ਪੈਨਲ ਸਮੀਕਰਨ ਰੁਝਾਨਾਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਯਾਨੀ, ਨਾੜੀ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਾ ਡਾਊਨ-ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਅਤੇ ਹੋਰ ਸਾਰੇ ਪੈਨਲਾਂ ਦਾ ਅਪ-ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ। ਇਹਨਾਂ 70 ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਸਿਰਫ਼ 10 ਨੇ AD ਭਰਪੂਰਤਾ ਵਿੱਚ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦਿਖਾਈਆਂ ਜੋ ਇਹਨਾਂ ਪੈਨਲ ਰੁਝਾਨਾਂ ਦਾ ਖੰਡਨ ਕਰਦੀਆਂ ਹਨ। ਇੱਕ ਪੈਨਲ ਤਿਆਰ ਕਰਨ ਲਈ ਜੋ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਦੇ ਸਮੁੱਚੇ ਰੁਝਾਨ ਨੂੰ ਸਭ ਤੋਂ ਵਧੀਆ ਢੰਗ ਨਾਲ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਅਸੀਂ ਇਹਨਾਂ 10 ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਨੂੰ ਦਿਲਚਸਪੀ ਦੇ ਪੈਨਲ ਤੋਂ ਬਾਹਰ ਰੱਖਿਆ ਹੈ ਜਿਸਦੀ ਅਸੀਂ ਅੰਤ ਵਿੱਚ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕੀਤੀ (ਚਿੱਤਰ 5A)। ਇਸ ਲਈ, ਸਾਡੇ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਅੰਤ ਵਿੱਚ ਵੱਖੋ ਵੱਖਰੇ ਨਮੂਨੇ ਦੀ ਤਿਆਰੀ ਅਤੇ MS ਪਲੇਟਫਾਰਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਦੋ ਸੁਤੰਤਰ CSF AD ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕੁੱਲ 60 ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। CSF ਕਾਪੀ 1 ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ AD ਕੇਸਾਂ ਵਿੱਚ ਇਹਨਾਂ ਅੰਤਮ ਪੈਨਲਾਂ ਦੇ z-ਸਕੋਰ ਸਮੀਕਰਨ ਪਲਾਟ ਨੇ ਸਾਡੇ ਦੁਆਰਾ ਪਾਏ ਗਏ CSF ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਦੇਖੇ ਗਏ ਪੈਨਲ ਰੁਝਾਨ ਦੀ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕੀਤੀ (ਚਿੱਤਰ 5B)।
ਇਹਨਾਂ 60 ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚ, AD ਨਾਲ ਸਬੰਧਿਤ ਜਾਣੇ ਜਾਂਦੇ ਅਣੂ ਹਨ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਓਸਟੀਓਪੌਂਟਿਨ (SPP1), ਜੋ ਕਿ ਇੱਕ ਪ੍ਰੋ-ਇਨਫਲਾਮੇਟਰੀ ਸਾਈਟੋਕਾਈਨ ਹੈ ਜੋ ਕਿ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਅਧਿਐਨਾਂ (39-41) ਵਿੱਚ AD ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਹੈ, ਅਤੇ GAP43, ਇੱਕ ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਹੈ। ਜੋ ਕਿ ਸਪੱਸ਼ਟ ਤੌਰ 'ਤੇ neurodegeneration (42) ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਹੈ। ਸਭ ਤੋਂ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਹੋਰ ਨਿਊਰੋਡੀਜਨਰੇਟਿਵ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਮਾਰਕਰ ਹਨ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਐਮੀਓਟ੍ਰੋਫਿਕ ਲੈਟਰਲ ਸਕਲੇਰੋਸਿਸ (ਏ.ਐਲ.ਐਸ.) ਸਬੰਧਤ ਸੁਪਰਆਕਸਾਈਡ ਡਿਸਮੂਟੇਜ਼ 1 (ਐਸ.ਓ.ਡੀ.1) ਅਤੇ ਪਾਰਕਿੰਸਨ'ਸ ਰੋਗ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਡੀਸੈਕਰੇਸ (PARK7)। ਅਸੀਂ ਇਹ ਵੀ ਤਸਦੀਕ ਕੀਤਾ ਹੈ ਕਿ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਹੋਰ ਮਾਰਕਰ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ SMOC1 ਅਤੇ ਦਿਮਾਗ-ਅਮੀਰ ਝਿੱਲੀ ਅਟੈਚਮੈਂਟ ਸਿਗਨਲਿੰਗ ਪ੍ਰੋਟੀਨ 1 (BASP1), ਨੇ ਨਿਊਰੋਡੀਜਨਰੇਸ਼ਨ ਲਈ ਪਿਛਲੇ ਲਿੰਕ ਸੀਮਤ ਕੀਤੇ ਹਨ। ਇਹ ਧਿਆਨ ਦੇਣ ਯੋਗ ਹੈ ਕਿ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਵਿੱਚ ਉਹਨਾਂ ਦੀ ਘੱਟ ਸਮੁੱਚੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੇ ਕਾਰਨ, ਸਾਡੇ ਲਈ MAPT ਅਤੇ ਕੁਝ ਹੋਰ AD-ਸਬੰਧਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ (ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, NEFL ਅਤੇ NRGN) ਨੂੰ ਭਰੋਸੇਯੋਗ ਢੰਗ ਨਾਲ ਖੋਜਣ ਲਈ ਇਸ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ ਸਿੰਗਲ-ਸ਼ਾਟ ਖੋਜ ਵਿਧੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਨਾ ਮੁਸ਼ਕਲ ਹੈ। ) ( 43, 44)।
ਅਸੀਂ ਫਿਰ ਇਹਨਾਂ 60 ਤਰਜੀਹੀ ਪੈਨਲ ਮਾਰਕਰਾਂ ਨੂੰ ਤਿੰਨ ਵਾਧੂ ਨਕਲ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਵਿੱਚ ਚੈੱਕ ਕੀਤਾ। CSF ਕਾਪੀ 2 ਵਿੱਚ, ਅਸੀਂ ਏਮੋਰੀ ਗੋਇਜ਼ੁਏਟਾ ਏਡੀਆਰਸੀ (17) ਤੋਂ 297 ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ AD ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੇ ਇੱਕ ਸੁਤੰਤਰ ਸਮੂਹ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਸਿੰਗਲ TMT-MS ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ। CSF ਰੀਪਲੀਕੇਸ਼ਨ 3 ਵਿੱਚ 120 ਨਿਯੰਤਰਣ ਤੋਂ ਉਪਲਬਧ TMT-MS ਡੇਟਾ ਅਤੇ ਲੌਸੇਨ, ਸਵਿਟਜ਼ਰਲੈਂਡ (45) ਤੋਂ AD ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਦਾ ਪੁਨਰ-ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਅਸੀਂ ਹਰੇਕ ਡੇਟਾਸੈਟ ਵਿੱਚ 60 ਤਰਜੀਹੀ ਮਾਰਕਰਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਦੋ ਤਿਹਾਈ ਤੋਂ ਵੱਧ ਖੋਜੇ ਹਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ ਸਵਿਸ ਅਧਿਐਨ ਨੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ MS ਪਲੇਟਫਾਰਮਾਂ ਅਤੇ TMT ਮਾਪਦੰਡ ਵਿਧੀਆਂ (45, 46) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ, ਅਸੀਂ ਦੋ ਵਾਰ-ਵਾਰ ਕੀਤੇ ਗਏ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ (ਚਿੱਤਰ 5, C ਅਤੇ D, ਅਤੇ ਟੇਬਲ S2, I, ਅਤੇ J) ਵਿੱਚ ਸਾਡੇ ਪੈਨਲ ਰੁਝਾਨਾਂ ਨੂੰ ਜ਼ੋਰਦਾਰ ਢੰਗ ਨਾਲ ਦੁਬਾਰਾ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ। ਸਾਡੇ ਸਮੂਹ ਦੀ ਬਿਮਾਰੀ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਨ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਚੌਥੇ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ (CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ 4) ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ TMT-MS ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਨਾ ਸਿਰਫ਼ ਨਿਯੰਤਰਣ (n = 18) ਅਤੇ AD (n = 17) ਕੇਸ ਸ਼ਾਮਲ ਸਨ, ਸਗੋਂ PD ( n = 14)), ALS (n = 18) ਅਤੇ ਫਰੰਟੋਟੇਮਪੋਰਲ ਡਿਮੈਂਸ਼ੀਆ (FTD) ਨਮੂਨੇ (n = 11) (ਸਾਰਣੀ S1A)। ਅਸੀਂ ਇਸ ਸਮੂਹ (60 ਵਿੱਚੋਂ 38) ਵਿੱਚ ਲਗਭਗ ਦੋ ਤਿਹਾਈ ਪੈਨਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੂੰ ਸਫਲਤਾਪੂਰਵਕ ਮਾਪਿਆ। ਇਹ ਨਤੀਜੇ ਸਾਰੇ ਪੰਜ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਪੈਨਲਾਂ (ਚਿੱਤਰ 5E ਅਤੇ ਟੇਬਲ S2K) ਵਿੱਚ AD-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਮੈਟਾਬੋਲਾਈਟ ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਵਾਧੇ ਨੇ ਸਭ ਤੋਂ ਮਜ਼ਬੂਤ AD ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਦਿਖਾਈ, ਇਸਦੇ ਬਾਅਦ ਮਾਈਲੀਨੇਸ਼ਨ ਅਤੇ ਗਲਾਈਅਲ ਸਮੂਹ। ਕੁਝ ਹੱਦ ਤੱਕ, FTD ਇਹਨਾਂ ਪੈਨਲਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਵਾਧਾ ਵੀ ਦਿਖਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਸਮਾਨ ਸੰਭਾਵੀ ਨੈਟਵਰਕ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ (17). ਇਸਦੇ ਉਲਟ, ALS ਅਤੇ PD ਨੇ ਨਿਯੰਤਰਣ ਸਮੂਹ ਦੇ ਤੌਰ ਤੇ ਲਗਭਗ ਉਹੀ ਮਾਈਲੀਨੇਸ਼ਨ, ਗਲੀਅਲ, ਅਤੇ ਮੈਟਾਬੋਲੋਮ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲ ਦਿਖਾਏ। ਸਮੁੱਚੇ ਤੌਰ 'ਤੇ, ਨਮੂਨਾ ਤਿਆਰ ਕਰਨ, MS ਪਲੇਟਫਾਰਮ, ਅਤੇ TMT ਮਾਪਣ ਵਿਧੀਆਂ ਵਿੱਚ ਅੰਤਰ ਦੇ ਬਾਵਜੂਦ, ਇਹ ਵਾਰ-ਵਾਰ ਕੀਤੇ ਗਏ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ ਸਾਡੇ ਤਰਜੀਹੀ ਪੈਨਲ ਮਾਰਕਰਾਂ ਵਿੱਚ 500 ਤੋਂ ਵੱਧ ਵਿਲੱਖਣ CSF ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ AD-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਹਨ।
AD neurodegeneration ਨੂੰ ਬੋਧਾਤਮਕ ਲੱਛਣਾਂ ਦੀ ਸ਼ੁਰੂਆਤ ਤੋਂ ਕਈ ਸਾਲ ਪਹਿਲਾਂ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮਾਨਤਾ ਦਿੱਤੀ ਗਈ ਹੈ, ਇਸ ਲਈ AsymAD (5, 31) ਦੇ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਤੁਰੰਤ ਲੋੜ ਹੈ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਵੱਧ ਤੋਂ ਵੱਧ ਸਬੂਤ ਇਹ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ ਅਸੀਮਏਡੀ ਦਾ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨ ਸਮਰੂਪਤਾ ਤੋਂ ਬਹੁਤ ਦੂਰ ਹੈ, ਅਤੇ ਜੋਖਮ ਅਤੇ ਲਚਕੀਲੇਪਨ ਦੀ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਵਿੱਚ ਵੱਡੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਅੰਤਰ ਵੱਲ ਖੜਦਾ ਹੈ (47). ਹਾਲਾਂਕਿ AsymAD ਕੇਸਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਕੋਰ CSF ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਸ (Aβ1-42, ਕੁੱਲ tau ਅਤੇ p-tau) ਦੇ ਪੱਧਰਾਂ ਨੇ ਇਹ ਸਾਬਤ ਨਹੀਂ ਕੀਤਾ ਹੈ ਕਿ ਕੌਣ ਡਿਮੇਨਸ਼ੀਆ (4, 7) ਵਿੱਚ ਅੱਗੇ ਵਧੇਗਾ, ਜੋ ਕਿ ਹੋਰ ਸੰਕੇਤ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਆਬਾਦੀ ਦੇ ਖਤਰੇ ਨੂੰ ਸਹੀ ਢੰਗ ਨਾਲ ਪੱਧਰਾ ਕਰਨ ਲਈ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਸਰੀਰ ਵਿਗਿਆਨ ਦੇ ਕਈ ਪਹਿਲੂਆਂ 'ਤੇ ਆਧਾਰਿਤ ਸੰਪੂਰਨ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੂਲਸ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨਾ ਜ਼ਰੂਰੀ ਹੈ। ਇਸਲਈ, ਅਸੀਂ ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ CSF ਕਾਪੀ 1 ਦੀ AsymAD ਆਬਾਦੀ ਵਿੱਚ ਸਾਡੇ AD-ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਪੈਨਲ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ। ਇਹਨਾਂ 31 AsymAD ਕੇਸਾਂ ਨੇ ਅਸਧਾਰਨ ਕੋਰ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਪੱਧਰ (Aβ1–42/ਕੁੱਲ ਟਾਊ ਏਲੀਸਾ ਅਨੁਪਾਤ, <5.5) ਅਤੇ ਸੰਪੂਰਨ ਬੋਧ (ਮਤਲਬ MoCA, 271) ਦਿਖਾਇਆ। ± 2.2) (ਸਾਰਣੀ S1A)। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, AsymAD ਵਾਲੇ ਸਾਰੇ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਦਾ ਕਲੀਨਿਕਲ ਡਿਮੈਂਸ਼ੀਆ ਸਕੋਰ 0 ਹੈ, ਜੋ ਇਹ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਰੋਜ਼ਾਨਾ ਬੋਧਾਤਮਕ ਜਾਂ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਗਿਰਾਵਟ ਦਾ ਕੋਈ ਸਬੂਤ ਨਹੀਂ ਹੈ।
ਅਸੀਂ ਪਹਿਲਾਂ ਸਾਰੇ 96 CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀਆਂ 1 ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਪੈਨਲਾਂ ਦੇ ਪੱਧਰਾਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ, AsymAD ਸਮੂਹ ਸਮੇਤ। ਅਸੀਂ ਪਾਇਆ ਕਿ AsymAD ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਕਈ ਪੈਨਲਾਂ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ AD-ਵਰਗੇ ਭਰਪੂਰ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਸਨ, ਨਾੜੀ ਪੈਨਲ ਨੇ AsymAD ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਹੇਠਾਂ ਵੱਲ ਰੁਝਾਨ ਦਿਖਾਇਆ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਹੋਰ ਸਾਰੇ ਪੈਨਲਾਂ ਨੇ ਉੱਪਰ ਵੱਲ ਰੁਝਾਨ ਦਿਖਾਇਆ (ਚਿੱਤਰ 6A). ਇਸ ਲਈ, ਸਾਰੇ ਪੈਨਲਾਂ ਨੇ ELISA Aβ1-42 ਅਤੇ ਕੁੱਲ ਤਾਊ ਪੱਧਰਾਂ (ਚਿੱਤਰ 6B) ਨਾਲ ਇੱਕ ਬਹੁਤ ਹੀ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਸਬੰਧ ਦਿਖਾਇਆ। ਇਸ ਦੇ ਉਲਟ, ਸਮੂਹ ਅਤੇ MoCA ਸਕੋਰ ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧ ਮੁਕਾਬਲਤਨ ਮਾੜਾ ਹੈ। ਇਹਨਾਂ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਇੱਕ ਹੋਰ ਹੈਰਾਨੀਜਨਕ ਖੋਜਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਇੱਕ ਹੈ AsymAD ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਪੈਨਲ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੀ ਵਿਸ਼ਾਲ ਸ਼੍ਰੇਣੀ। ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਚਿੱਤਰ 6A ਵਿੱਚ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ, AsymAD ਸਮੂਹ ਦਾ ਪੈਨਲ ਪੱਧਰ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਿਯੰਤਰਣ ਸਮੂਹ ਅਤੇ AD ਸਮੂਹ ਦੇ ਪੈਨਲ ਪੱਧਰ ਨੂੰ ਪਾਰ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਮੁਕਾਬਲਤਨ ਉੱਚ ਪਰਿਵਰਤਨਸ਼ੀਲਤਾ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ। AsymAD ਦੀ ਇਸ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦੀ ਹੋਰ ਪੜਚੋਲ ਕਰਨ ਲਈ, ਅਸੀਂ 96 CSF ਰੀਪਲੀਕੇਸ਼ਨ 1 ਕੇਸਾਂ ਲਈ ਮਲਟੀਡਾਇਮੈਂਸ਼ਨਲ ਸਕੇਲਿੰਗ (MDS) ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਲਾਗੂ ਕੀਤਾ। MDS ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਡੇਟਾ ਸੈਟ ਵਿੱਚ ਕੁਝ ਵੇਰੀਏਬਲਾਂ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਕੇਸਾਂ ਵਿੱਚ ਸਮਾਨਤਾ ਦੀ ਕਲਪਨਾ ਕਰਨ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਕਲੱਸਟਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਸਿਰਫ਼ ਉਹਨਾਂ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਪੈਨਲ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਵਿੱਚ CSF ਖੋਜ ਅਤੇ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ 1 ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ (n = 29) (ਟੇਬਲ S2L) ਪੱਧਰ ਵਿੱਚ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤਬਦੀਲੀ (P <0.05, AD/control) ਹੈ। ਇਸ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਸਾਡੇ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ AD ਕੇਸਾਂ (ਚਿੱਤਰ 6C) ਵਿਚਕਾਰ ਸਪਸ਼ਟ ਸਥਾਨਿਕ ਕਲੱਸਟਰਿੰਗ ਪੈਦਾ ਕੀਤੀ। ਇਸ ਦੇ ਉਲਟ, ਕੁਝ AsymAD ਕੇਸ ਸਪੱਸ਼ਟ ਤੌਰ 'ਤੇ ਕੰਟਰੋਲ ਗਰੁੱਪ ਵਿੱਚ ਕਲੱਸਟਰ ਕੀਤੇ ਗਏ ਹਨ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਦੂਸਰੇ AD ਕੇਸਾਂ ਵਿੱਚ ਸਥਿਤ ਹਨ। ਇਸ AsymAD ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦੀ ਹੋਰ ਪੜਚੋਲ ਕਰਨ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਇਹਨਾਂ AsymAD ਕੇਸਾਂ ਦੇ ਦੋ ਸਮੂਹਾਂ ਨੂੰ ਪਰਿਭਾਸ਼ਿਤ ਕਰਨ ਲਈ ਆਪਣੇ MDS ਨਕਸ਼ੇ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ। ਪਹਿਲੇ ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਨਿਯੰਤਰਣ (n = 19) ਦੇ ਨੇੜੇ ਕਲੱਸਟਰ ਕੀਤੇ AsymAD ਕੇਸ ਸ਼ਾਮਲ ਸਨ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਦੂਜੇ ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ AD (n = 12) ਦੇ ਨੇੜੇ ਮਾਰਕਰ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲ ਦੇ ਨਾਲ AsymAD ਕੇਸਾਂ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਸੀ।
(ਏ) CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ 1 ਸਮੂਹ ਦੇ ਸਾਰੇ 96 ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ CSF ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਸਮੂਹ ਦਾ ਸਮੀਕਰਨ ਪੱਧਰ (z-ਸਕੋਰ), AsymAD ਸਮੇਤ। ਪੈਨਲ ਭਰਪੂਰ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੇ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਮਹੱਤਵ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਨ ਲਈ ਟੂਕੇ ਦੇ ਪੋਸਟ-ਸੁਧਾਈ ਦੇ ਨਾਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ। (ਬੀ) ਐਮਓਸੀਏ ਸਕੋਰ ਦੇ ਨਾਲ ਪੈਨਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਭਰਪੂਰਤਾ ਪੱਧਰ (ਜ਼ੈੱਡ-ਸਕੋਰ) ਅਤੇ ਏਲੀਸਾ Aβ1-42 ਅਤੇ CSF ਕਾਪੀ 1 ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਕੁੱਲ ਤਾਊ ਪੱਧਰ ਦਾ ਸਬੰਧ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ। ਸੰਬੰਧਿਤ P ਮੁੱਲ ਦੇ ਨਾਲ ਪੀਅਰਸਨ ਸਹਿ-ਸੰਬੰਧ ਗੁਣਾਂਕ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। (C) 96 CSF ਕਾਪੀ 1 ਕੇਸਾਂ ਦਾ MDS 29 ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਪੈਨਲ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੇ ਪੱਧਰਾਂ 'ਤੇ ਅਧਾਰਤ ਸੀ, ਜੋ ਕਿ ਖੋਜ ਅਤੇ CSF ਕਾਪੀ 1 ਡੇਟਾ ਸੈੱਟਾਂ [ਪੀ <0.05 AD/ਕੰਟਰੋਲ (CT)] ਦੋਵਾਂ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਦਲਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਇਹ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ AsymAD ਸਮੂਹ ਨੂੰ ਨਿਯੰਤਰਣ (n = 19) ਅਤੇ AD (n = 12) ਉਪ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਵੰਡਣ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। (D) ਜਵਾਲਾਮੁਖੀ ਪਲਾਟ ਦੋ AsymAD ਉਪ-ਸਮੂਹਾਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ -log10 ਅੰਕੜਾ P ਮੁੱਲ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰੀ log2 ਫੋਲਡ ਬਦਲਾਅ (x-ਧੁਰਾ) ਦੇ ਨਾਲ ਸਾਰੇ CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ 1 ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਦੀ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਿਖਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਪੈਨਲ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਰੰਗਦਾਰ ਹਨ। (ਈ) CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ 1 ਚੋਣ ਸਮੂਹ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦਾ ਪੱਧਰ AsymAD ਉਪ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। ਟੂਕੀ ਦੇ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਦੇ ਪੋਸਟ-ਅਡਜਸਟਡ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਅੰਕੜਾਤਮਕ ਮਹੱਤਤਾ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਨ ਲਈ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ।
ਅਸੀਂ ਇਹਨਾਂ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ AD-ਵਰਗੇ AsymAD ਕੇਸਾਂ (ਚਿੱਤਰ 6D ਅਤੇ ਟੇਬਲ S2L) ਵਿਚਕਾਰ ਅੰਤਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕੀਤੀ। ਨਤੀਜੇ ਵਜੋਂ ਜੁਆਲਾਮੁਖੀ ਦਾ ਨਕਸ਼ਾ ਦਿਖਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਦੋ ਸਮੂਹਾਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ 14 ਪੈਨਲ ਮਾਰਕਰ ਕਾਫ਼ੀ ਬਦਲ ਗਏ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਮਾਰਕਰ ਸਿਨੇਪਸ ਅਤੇ ਮੈਟਾਬੋਲੋਮ ਦੇ ਮੈਂਬਰ ਹਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ, SOD1 ਅਤੇ myristoylated alanine-rich protein kinase C substrate (MARCKS), ਜੋ ਕਿ ਕ੍ਰਮਵਾਰ ਮਾਈਲਿਨ ਅਤੇ ਗਲੀਅਲ ਇਮਿਊਨ ਗਰੁੱਪ ਦੇ ਮੈਂਬਰ ਹਨ, ਵੀ ਇਸ ਸਮੂਹ (ਚਿੱਤਰ 6, D ਅਤੇ E) ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹਨ। ਵੈਸਕੁਲਰ ਪੈਨਲ ਨੇ ਦੋ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦਾ ਵੀ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਇਆ ਜੋ ਕਿ ਏ.ਈ. ਬਾਈਡਿੰਗ ਪ੍ਰੋਟੀਨ 1 (AEBP1) ਅਤੇ ਪੂਰਕ ਪਰਿਵਾਰਕ ਮੈਂਬਰ C9 ਸਮੇਤ AD-ਵਰਗੇ AsymAD ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਘਟਾਏ ਗਏ ਸਨ। ELISA AB1-42 (P = 0.38) ਅਤੇ p-tau (P = 0.28) ਵਿੱਚ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ AD-ਵਰਗੇ AsymAD ਉਪ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਕੋਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਅੰਤਰ ਨਹੀਂ ਸੀ, ਪਰ ਅਸਲ ਵਿੱਚ ਕੁੱਲ ਤਾਊ ਪੱਧਰ (P = 0.0031) ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਅੰਤਰ ਸੀ। ) (ਚਿੱਤਰ S7). ਇੱਥੇ ਕਈ ਪੈਨਲ ਮਾਰਕਰ ਹਨ ਜੋ ਇਹ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ ਦੋ AsymAD ਉਪ-ਸਮੂਹਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਕੁੱਲ ਟਾਊ ਪੱਧਰਾਂ (ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, YWHAZ, SOD1, ਅਤੇ MDH1) (ਚਿੱਤਰ 6E) ਨਾਲੋਂ ਵਧੇਰੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹਨ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਨਤੀਜੇ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ ਸਾਡੇ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਹੋ ਸਕਦੇ ਹਨ ਜੋ ਲੱਛਣ ਰਹਿਤ ਰੋਗ ਵਾਲੇ ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਦੀ ਉਪ-ਕਿਸਮ ਅਤੇ ਸੰਭਾਵੀ ਜੋਖਮ ਪੱਧਰੀਕਰਨ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ।
AD ਦੇ ਪਿੱਛੇ ਵਿਭਿੰਨ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਨੂੰ ਬਿਹਤਰ ਢੰਗ ਨਾਲ ਮਾਪਣ ਅਤੇ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਬਣਾਉਣ ਲਈ ਸਿਸਟਮ-ਅਧਾਰਿਤ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੂਲਸ ਦੀ ਤੁਰੰਤ ਲੋੜ ਹੈ। ਇਹਨਾਂ ਸਾਧਨਾਂ ਤੋਂ ਨਾ ਸਿਰਫ਼ ਸਾਡੇ AD ਡਾਇਗਨੌਸਟਿਕ ਫਰੇਮਵਰਕ ਨੂੰ ਬਦਲਣ ਦੀ ਉਮੀਦ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਸਗੋਂ ਪ੍ਰਭਾਵੀ, ਮਰੀਜ਼-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਇਲਾਜ ਰਣਨੀਤੀਆਂ (1, 2) ਨੂੰ ਅਪਣਾਉਣ ਨੂੰ ਵੀ ਉਤਸ਼ਾਹਿਤ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਅੰਤ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਵੈਬ-ਅਧਾਰਤ CSF ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਲਈ AD ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ CSF ਲਈ ਇੱਕ ਨਿਰਪੱਖ ਵਿਆਪਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਪਹੁੰਚ ਨੂੰ ਲਾਗੂ ਕੀਤਾ ਜੋ ਦਿਮਾਗ-ਅਧਾਰਤ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ ਦੀ ਇੱਕ ਵਿਸ਼ਾਲ ਸ਼੍ਰੇਣੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਸਾਡੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਪੰਜ CSF ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਪੈਨਲ ਤਿਆਰ ਕੀਤੇ, ਜੋ (i) ਸਿਨੇਪਸ, ਖੂਨ ਦੀਆਂ ਨਾੜੀਆਂ, ਮਾਈਲਿਨ, ਇਮਿਊਨ ਅਤੇ ਪਾਚਕ ਨਪੁੰਸਕਤਾ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ; (ii) ਵੱਖ-ਵੱਖ MS ਪਲੇਟਫਾਰਮਾਂ 'ਤੇ ਮਜ਼ਬੂਤ ਪ੍ਰਜਨਨਯੋਗਤਾ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ; (iii) AD ਦੇ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਅਤੇ ਅਖੀਰਲੇ ਪੜਾਵਾਂ ਦੌਰਾਨ ਪ੍ਰਗਤੀਸ਼ੀਲ ਬਿਮਾਰੀ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦਿਖਾਓ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਖੋਜਾਂ AD ਖੋਜ ਅਤੇ ਕਲੀਨਿਕਲ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਲਈ ਵਿਭਿੰਨ, ਭਰੋਸੇਮੰਦ, ਵੈਬ-ਅਧਾਰਿਤ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਟੂਲਸ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਵੱਲ ਇੱਕ ਸ਼ਾਨਦਾਰ ਕਦਮ ਦਰਸਾਉਂਦੀਆਂ ਹਨ।
ਸਾਡੇ ਨਤੀਜੇ AD ਬ੍ਰੇਨ ਨੈਟਵਰਕ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੇ ਉੱਚ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਸੰਗਠਨ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਸਿਸਟਮ-ਅਧਾਰਿਤ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਵਿਕਾਸ ਲਈ ਐਂਕਰ ਵਜੋਂ ਇਸਦੀ ਵਰਤੋਂ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਸਾਡਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ AD ਅਤੇ AsymAD ਦਿਮਾਗ ਵਾਲੇ ਦੋ ਸੁਤੰਤਰ TMT-MS ਡੇਟਾਸੇਟਾਂ ਵਿੱਚ ਮਜ਼ਬੂਤ ਮਾਡਿਊਲਰਿਟੀ ਹੈ। ਇਹ ਖੋਜਾਂ ਸਾਡੇ ਪਿਛਲੇ ਕੰਮ ਨੂੰ ਵਧਾਉਂਦੀਆਂ ਹਨ, ਫਰੰਟਲ, ਪੈਰੀਟਲ, ਅਤੇ ਟੈਂਪੋਰਲ ਕਾਰਟੈਕਸ (17) ਵਿੱਚ ਕਈ ਸੁਤੰਤਰ ਸਮੂਹਾਂ ਤੋਂ 2,000 ਤੋਂ ਵੱਧ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਦੇ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਮਾਡਿਊਲਾਂ ਦੀ ਸੰਭਾਲ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਕਰਦੀਆਂ ਹਨ। ਇਹ ਸਹਿਮਤੀ ਨੈਟਵਰਕ ਮੌਜੂਦਾ ਖੋਜ ਵਿੱਚ ਦੇਖੇ ਗਏ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਰੋਗ-ਸਬੰਧਤ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਗਲਾਈਲ-ਅਮੀਰ ਸੋਜਸ਼ ਮਾਡਿਊਲਾਂ ਦਾ ਵਾਧਾ ਅਤੇ ਨਿਊਰੋਨ-ਅਮੀਰ ਮਾਡਿਊਲਾਂ ਦੀ ਕਮੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਮੌਜੂਦਾ ਖੋਜ ਦੀ ਤਰ੍ਹਾਂ, ਇਸ ਵੱਡੇ ਪੈਮਾਨੇ ਦੇ ਨੈਟਵਰਕ ਵਿੱਚ ਅਸੀਮਏਡੀ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਮਾਡਯੂਲਰ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਵੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਜੋ ਕਿ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪ੍ਰੈਕਲੀਨਿਕਲ ਪੈਥੋਫਿਜ਼ੀਓਲੋਜੀ (17) ਦੀ ਇੱਕ ਕਿਸਮ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀਆਂ ਹਨ।
ਹਾਲਾਂਕਿ, ਇਸ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਰੂੜੀਵਾਦੀ ਪ੍ਰਣਾਲੀ-ਆਧਾਰਿਤ ਢਾਂਚੇ ਦੇ ਅੰਦਰ, ਵਧੇਰੇ ਵਧੀਆ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਹੈ, ਖਾਸ ਕਰਕੇ AD ਦੇ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਪੜਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਵਿੱਚ। ਸਾਡਾ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਪੈਨਲ AsymAD ਵਿੱਚ ਦੋ ਉਪ ਸਮੂਹਾਂ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਣ ਦੇ ਯੋਗ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਮਲਟੀਪਲ CSF ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਵਿਭਿੰਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਸਾਡਾ ਸਮੂਹ ਇਹਨਾਂ ਦੋ ਉਪ ਸਮੂਹਾਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਜੈਵਿਕ ਅੰਤਰ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਨ ਦੇ ਯੋਗ ਸੀ, ਜੋ ਕਿ ਕੋਰ AD ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਸਪੱਸ਼ਟ ਨਹੀਂ ਸਨ। ਨਿਯੰਤਰਣ ਸਮੂਹ ਦੇ ਮੁਕਾਬਲੇ, ਇਹਨਾਂ AsymAD ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਦੇ Aβ1-42/ਕੁੱਲ ਟਾਊ ਅਨੁਪਾਤ ਅਸਧਾਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਘੱਟ ਸਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਦੋ AsymAD ਉਪ-ਸਮੂਹਾਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਕੇਵਲ ਕੁੱਲ ਤਾਊ ਪੱਧਰ ਹੀ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵੱਖਰੇ ਸਨ, ਜਦੋਂ ਕਿ Aβ1-42 ਅਤੇ p-tau ਪੱਧਰ ਮੁਕਾਬਲਤਨ ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਰਹੇ। ਕਿਉਂਕਿ ਉੱਚ CSF ਟਾਊ Aβ1-42 ਪੱਧਰਾਂ (7) ਨਾਲੋਂ ਬੋਧਾਤਮਕ ਲੱਛਣਾਂ ਦਾ ਇੱਕ ਬਿਹਤਰ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕਰਨ ਵਾਲਾ ਜਾਪਦਾ ਹੈ, ਸਾਨੂੰ ਸ਼ੱਕ ਹੈ ਕਿ ਦੋ AsymAD ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਦੇ ਵੱਖੋ-ਵੱਖਰੇ ਜੋਖਮ ਹੋ ਸਕਦੇ ਹਨ। ਸਾਡੇ AsymAD ਦੇ ਸੀਮਤ ਨਮੂਨੇ ਦੇ ਆਕਾਰ ਅਤੇ ਲੰਬਕਾਰੀ ਡੇਟਾ ਦੀ ਘਾਟ ਦੇ ਮੱਦੇਨਜ਼ਰ, ਇਹਨਾਂ ਸਿੱਟਿਆਂ ਨੂੰ ਭਰੋਸੇ ਨਾਲ ਕੱਢਣ ਲਈ ਹੋਰ ਖੋਜ ਦੀ ਲੋੜ ਹੈ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਇਹ ਨਤੀਜੇ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ ਇੱਕ ਸਿਸਟਮ-ਅਧਾਰਿਤ CSF ਪੈਨਲ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਲੱਛਣ ਰਹਿਤ ਪੜਾਅ ਦੇ ਦੌਰਾਨ ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਭਾਵਸ਼ਾਲੀ ਢੰਗ ਨਾਲ ਪੱਧਰਾ ਕਰਨ ਦੀ ਸਾਡੀ ਯੋਗਤਾ ਨੂੰ ਵਧਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।
ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਸਾਡੀਆਂ ਖੋਜਾਂ ਏ.ਡੀ. ਦੇ ਜਰਾਸੀਮ ਵਿੱਚ ਕਈ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਕਾਰਜਾਂ ਦੀ ਭੂਮਿਕਾ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਦੀਆਂ ਹਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਅਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਊਰਜਾ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ ਸਾਡੇ ਸਾਰੇ ਪੰਜ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਲੇਬਲਿੰਗ ਪੈਨਲਾਂ ਦਾ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਥੀਮ ਬਣ ਗਿਆ ਹੈ। ਮੈਟਾਬੋਲਿਕ ਪ੍ਰੋਟੀਨ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਹਾਈਪੋਕਸੈਨਥਾਈਨ-ਗੁਆਨਾਈਨ ਫਾਸਫੋਰੀਬੋਸਿਲਟ੍ਰਾਂਸਫੇਰੇਸ 1 (HPRT1) ਅਤੇ ਲੈਕਟੇਟ ਡੀਹਾਈਡ੍ਰੋਜਨੇਸ ਏ (LDHA), ਸਭ ਤੋਂ ਮਜ਼ਬੂਤੀ ਨਾਲ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਹਨ, ਜੋ ਇਹ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ ਕਿ AD CSF ਵਿੱਚ ਵਾਧਾ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਪ੍ਰਜਨਨਯੋਗ ਲਿੰਗ ਹੈ। ਸਾਡੀਆਂ ਖੂਨ ਦੀਆਂ ਨਾੜੀਆਂ ਅਤੇ ਗਲਾਈਲ ਪੈਨਲਾਂ ਵਿੱਚ ਆਕਸੀਡੇਟਿਵ ਪਦਾਰਥਾਂ ਦੇ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਕਈ ਮਾਰਕਰ ਵੀ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਇਹ ਖੋਜ ਮੁੱਖ ਭੂਮਿਕਾ ਦੇ ਨਾਲ ਇਕਸਾਰ ਹਨ ਜੋ ਪੂਰੇ ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਪਾਚਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਖੇਡਦੀਆਂ ਹਨ, ਨਾ ਸਿਰਫ ਨਿਊਰੋਨਸ ਦੀ ਉੱਚ ਊਰਜਾ ਦੀ ਮੰਗ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਕਰਨ ਲਈ, ਸਗੋਂ ਐਸਟ੍ਰੋਸਾਈਟਸ ਅਤੇ ਹੋਰ ਗਲਾਈਅਲ ਸੈੱਲਾਂ (17, 48) ਦੀ ਉੱਚ ਊਰਜਾ ਦੀ ਮੰਗ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਕਰਨ ਲਈ ਵੀ. ਸਾਡੇ ਨਤੀਜੇ ਵਧ ਰਹੇ ਸਬੂਤਾਂ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਦੇ ਹਨ ਕਿ redox ਸੰਭਾਵੀ ਵਿੱਚ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਅਤੇ ਊਰਜਾ ਮਾਰਗਾਂ ਵਿੱਚ ਰੁਕਾਵਟ AD ਦੇ ਜਰਾਸੀਮ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਕਈ ਮੁੱਖ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਮੁੱਖ ਲਿੰਕ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਮਾਈਟੋਕੌਂਡਰੀਅਲ ਵਿਕਾਰ, ਗਲਾਈਲ-ਵਿਚੋਲੇ ਵਾਲੀ ਸੋਜਸ਼, ਅਤੇ ਨਾੜੀ ਨੁਕਸਾਨ (49) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਪਾਚਕ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਵਿੱਚ ਸਾਡੇ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ AD-ਵਰਗੇ AsymAD ਉਪ-ਸਮੂਹਾਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਇੱਕ ਵੱਡੀ ਗਿਣਤੀ ਵਿੱਚ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਭਰਪੂਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਇਹ ਸੁਝਾਅ ਦਿੰਦੇ ਹਨ ਕਿ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਪੂਰਵ-ਨਿਰਮਾਣ ਪੜਾਅ ਵਿੱਚ ਇਹਨਾਂ ਊਰਜਾਵਾਂ ਅਤੇ ਰੇਡੌਕਸ ਮਾਰਗਾਂ ਦਾ ਵਿਘਨ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ।
ਸਾਡੇ ਦੁਆਰਾ ਦੇਖੇ ਗਏ ਵੱਖੋ-ਵੱਖਰੇ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਸੇਰਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਪੈਨਲ ਦੇ ਰੁਝਾਨਾਂ ਦੇ ਵੀ ਦਿਲਚਸਪ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਭਾਵ ਹਨ। ਨਿਊਰੋਨਸ ਨਾਲ ਭਰਪੂਰ ਸਿੰਨੈਪਸ ਅਤੇ ਮੈਟਾਬੋਲੋਮ AD ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਘਟੇ ਹੋਏ ਪੱਧਰ ਅਤੇ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤਾਤ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਇਹ ਧਿਆਨ ਵਿੱਚ ਰੱਖਦੇ ਹੋਏ ਕਿ ਨਿਊਰੋਨ ਆਪਣੇ ਅਨੇਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਸਿਗਨਲਾਂ (50) ਲਈ ਊਰਜਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਨ ਲਈ ਸਿੰਨੈਪਸ ਵਿੱਚ ਊਰਜਾ ਪੈਦਾ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਮਾਈਟੋਕਾਂਡਰੀਆ ਵਿੱਚ ਅਮੀਰ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਇਹਨਾਂ ਦੋ ਨਿਊਰੋਨ ਸਮੂਹਾਂ ਦੇ ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ ਦੀ ਸਮਾਨਤਾ ਦੀ ਉਮੀਦ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ। ਨਯੂਰੋਨਸ ਦਾ ਨੁਕਸਾਨ ਅਤੇ ਨੁਕਸਾਨੇ ਗਏ ਸੈੱਲਾਂ ਦਾ ਬਾਹਰ ਕੱਢਣਾ ਬਾਅਦ ਦੀ ਬਿਮਾਰੀ ਵਿੱਚ ਇਹਨਾਂ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ CSF ਪੈਨਲ ਦੇ ਰੁਝਾਨਾਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ, ਪਰ ਉਹ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਪੈਨਲ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਨਹੀਂ ਕਰ ਸਕਦੇ ਜੋ ਅਸੀਂ ਦੇਖਦੇ ਹਾਂ (13). ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਅਸੈਂਪਟੋਮੈਟਿਕ ਬਿਮਾਰੀ ਵਿੱਚ ਇਹਨਾਂ ਖੋਜਾਂ ਲਈ ਇੱਕ ਸੰਭਵ ਵਿਆਖਿਆ ਅਸਧਾਰਨ ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਪ੍ਰੂਨਿੰਗ ਹੈ। ਮਾਊਸ ਮਾਡਲਾਂ ਵਿੱਚ ਨਵੇਂ ਸਬੂਤ ਇਹ ਸੁਝਾਅ ਦਿੰਦੇ ਹਨ ਕਿ ਮਾਈਕ੍ਰੋਗਲੀਆ-ਵਿਚੋਲਗੀ ਵਾਲੇ ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਫੈਗੋਸਾਈਟੋਸਿਸ AD ਵਿੱਚ ਅਸਧਾਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਰਗਰਮ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਸਿਨੈਪਸ ਦਾ ਨੁਕਸਾਨ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ (51). ਇਹ ਰੱਦ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਸਮੱਗਰੀ CSF ਵਿੱਚ ਇਕੱਠੀ ਹੋ ਸਕਦੀ ਹੈ, ਜਿਸ ਕਰਕੇ ਅਸੀਂ ਨਿਊਰੋਨ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ CSF ਵਿੱਚ ਵਾਧੇ ਨੂੰ ਦੇਖਦੇ ਹਾਂ। ਇਮਿਊਨ-ਮੀਡੀਏਟਿਡ ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਪ੍ਰੂਨਿੰਗ ਵੀ ਅੰਸ਼ਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਗਲਾਈਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਵਾਧੇ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਕਰ ਸਕਦੀ ਹੈ ਜੋ ਅਸੀਂ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਦਿਮਾਗੀ ਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਵਿੱਚ ਬਿਮਾਰੀ ਦੀ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਦੌਰਾਨ ਦੇਖਦੇ ਹਾਂ। ਸਿਨੈਪਟਿਕ ਪ੍ਰੌਨਿੰਗ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਐਕਸੋਸਾਈਟਿਕ ਪਾਥਵੇਅ ਵਿੱਚ ਸਮੁੱਚੀ ਅਸਧਾਰਨਤਾਵਾਂ ਵੀ ਦਿਮਾਗ ਅਤੇ ਨਿਊਰੋਨਲ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਵੱਖੋ-ਵੱਖਰੇ CSF ਸਮੀਕਰਨਾਂ ਦਾ ਕਾਰਨ ਬਣ ਸਕਦੀਆਂ ਹਨ। ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਅਧਿਐਨਾਂ ਨੇ ਦਿਖਾਇਆ ਹੈ ਕਿ AD ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਪੈਥੋਜੇਨੇਸਿਸ ਵਿੱਚ ਐਕਸੋਸੋਮਜ਼ ਦੀ ਸਮੱਗਰੀ ਬਦਲ ਗਈ ਹੈ (52). ਐਕਸਟਰਸੈਲੂਲਰ ਮਾਰਗ Aβ (53, 54) ਦੇ ਪ੍ਰਸਾਰ ਵਿੱਚ ਵੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਇਹ ਧਿਆਨ ਦੇਣ ਯੋਗ ਹੈ ਕਿ ਐਕਸੋਸੋਮਲ secretion ਨੂੰ ਦਬਾਉਣ ਨਾਲ AD ਟ੍ਰਾਂਸਜੇਨਿਕ ਮਾਊਸ ਮਾਡਲਾਂ (55) ਵਿੱਚ AD-ਵਰਗੇ ਰੋਗ ਵਿਗਿਆਨ ਨੂੰ ਘਟਾਇਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।
ਉਸੇ ਸਮੇਂ, ਵੈਸਕੁਲਰ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੇ AD ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮੱਧਮ ਵਾਧਾ ਦਿਖਾਇਆ, ਪਰ CSF ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ ਤੇ ਘਟਿਆ. ਖੂਨ-ਦਿਮਾਗ ਦੀ ਰੁਕਾਵਟ (BBB) ਨਪੁੰਸਕਤਾ ਅੰਸ਼ਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਇਹਨਾਂ ਖੋਜਾਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਕਰ ਸਕਦੀ ਹੈ। ਕਈ ਸੁਤੰਤਰ ਪੋਸਟਮਾਰਟਮ ਮਨੁੱਖੀ ਅਧਿਐਨਾਂ ਨੇ AD (56, 57) ਵਿੱਚ BBB ਟੁੱਟਣ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਕੀਤਾ ਹੈ। ਇਹਨਾਂ ਅਧਿਐਨਾਂ ਨੇ ਐਂਡੋਥੈਲਿਅਲ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀ ਇਸ ਕੱਸ ਕੇ ਸੀਲ ਕੀਤੀ ਪਰਤ ਦੇ ਆਲੇ ਦੁਆਲੇ ਦੀਆਂ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਅਸਧਾਰਨ ਗਤੀਵਿਧੀਆਂ ਦੀ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕੀਤੀ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਦਿਮਾਗ ਦੇ ਕੇਸ਼ਿਕਾ ਲੀਕੇਜ ਅਤੇ ਖੂਨ ਨਾਲ ਪੈਦਾ ਹੋਣ ਵਾਲੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (57) ਦਾ ਪੇਰੀਵੈਸਕੁਲਰ ਇਕੱਠਾ ਹੋਣਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਇਹ ਦਿਮਾਗ ਵਿੱਚ ਐਲੀਵੇਟਿਡ ਵੈਸਕੁਲਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਲਈ ਇੱਕ ਸਧਾਰਨ ਵਿਆਖਿਆ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ, ਪਰ ਇਹ ਸੇਰੇਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਵਿੱਚ ਇਹਨਾਂ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਦੀ ਕਮੀ ਦੀ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਵਿਆਖਿਆ ਨਹੀਂ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਇੱਕ ਸੰਭਾਵਨਾ ਇਹ ਹੈ ਕਿ ਕੇਂਦਰੀ ਨਸ ਪ੍ਰਣਾਲੀ ਵਧੀ ਹੋਈ ਸੋਜਸ਼ ਅਤੇ ਆਕਸੀਡੇਟਿਵ ਤਣਾਅ ਦੀ ਸਮੱਸਿਆ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕਰਨ ਲਈ ਇਹਨਾਂ ਅਣੂਆਂ ਨੂੰ ਸਰਗਰਮੀ ਨਾਲ ਅਲੱਗ ਕਰ ਰਹੀ ਹੈ। ਇਸ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਕੁਝ ਸਭ ਤੋਂ ਗੰਭੀਰ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਵਿੱਚ ਕਮੀ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਲਿਪੋਪ੍ਰੋਟੀਨ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ, ਸੋਜਸ਼ ਦੇ ਨੁਕਸਾਨਦੇਹ ਪੱਧਰਾਂ ਦੀ ਰੋਕਥਾਮ ਅਤੇ ਪ੍ਰਤੀਕਿਰਿਆਸ਼ੀਲ ਆਕਸੀਜਨ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਦੀ ਨਿਊਰੋਪ੍ਰੋਟੈਕਟਿਵ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹੈ। ਇਹ ਪੈਰੋਕਸੋਨੇਜ 1 (PON1) ਲਈ ਸੱਚ ਹੈ, ਇੱਕ ਲਿਪੋਪ੍ਰੋਟੀਨ ਬਾਈਡਿੰਗ ਐਂਜ਼ਾਈਮ ਜੋ ਸਰਕੂਲੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਆਕਸੀਡੇਟਿਵ ਤਣਾਅ ਦੇ ਪੱਧਰ ਨੂੰ ਘਟਾਉਣ ਲਈ ਜ਼ਿੰਮੇਵਾਰ ਹੈ (58, 59). ਅਲਫ਼ਾ-1-ਮਾਈਕਰੋਗਲੋਬੂਲਿਨ/ਬੀਕੁਨਿਨ ਪੂਰਵਗਾਮੀ (AMBP) ਨਾੜੀ ਸਮੂਹ ਦਾ ਇੱਕ ਹੋਰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਮਾਰਕਰ ਹੈ। ਇਹ ਲਿਪਿਡ ਟ੍ਰਾਂਸਪੋਰਟਰ ਬਿਕੁਨਿਨ ਦਾ ਪੂਰਵਗਾਮੀ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਸੋਜਸ਼ ਦਮਨ ਅਤੇ ਨਿਊਰੋਲੋਜੀਕਲ ਪ੍ਰੋਟੈਕਸ਼ਨ (60, 61) ਵਿੱਚ ਵੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ.
ਵੱਖ-ਵੱਖ ਦਿਲਚਸਪ ਧਾਰਨਾਵਾਂ ਦੇ ਬਾਵਜੂਦ, ਜੀਵ-ਰਸਾਇਣਕ ਰੋਗ ਵਿਧੀਆਂ ਨੂੰ ਸਿੱਧੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਖੋਜਣ ਦੀ ਅਯੋਗਤਾ ਖੋਜ-ਸੰਚਾਲਿਤ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਇੱਕ ਜਾਣੀ-ਪਛਾਣੀ ਸੀਮਾ ਹੈ। ਇਸ ਲਈ, ਇਹਨਾਂ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਪੈਨਲਾਂ ਦੇ ਪਿੱਛੇ ਦੀ ਵਿਧੀ ਨੂੰ ਭਰੋਸੇ ਨਾਲ ਪਰਿਭਾਸ਼ਿਤ ਕਰਨ ਲਈ ਹੋਰ ਖੋਜ ਜ਼ਰੂਰੀ ਹੈ। ਐਮਐਸ-ਅਧਾਰਤ ਕਲੀਨਿਕਲ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਵੱਲ ਵਧਣ ਲਈ, ਭਵਿੱਖ ਦੀ ਦਿਸ਼ਾ ਨੂੰ ਵੱਡੇ ਪੈਮਾਨੇ ਦੇ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਤਸਦੀਕ ਲਈ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਮਾਤਰਾਤਮਕ ਤਰੀਕਿਆਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਦੀ ਵੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਚੋਣਵੇਂ ਜਾਂ ਸਮਾਂਤਰ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਨਿਗਰਾਨੀ (62). ਅਸੀਂ ਹਾਲ ਹੀ ਵਿੱਚ ਇੱਥੇ ਵਰਣਿਤ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀਆਂ ਬਹੁਤ ਸਾਰੀਆਂ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕਰਨ ਲਈ ਸਮਾਂਤਰ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਨਿਗਰਾਨੀ (63) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ ਹੈ। ਕਈ ਤਰਜੀਹੀ ਪੈਨਲ ਟੀਚਿਆਂ ਨੂੰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਨਾਲ ਮਾਪਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ YWHAZ, ALDOA, ਅਤੇ SMOC1 ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਜੋ ਕ੍ਰਮਵਾਰ (63) ਸਾਡੇ ਸਿੰਨੈਪਸ, ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ, ਅਤੇ ਸੋਜਸ਼ ਪੈਨਲਾਂ ਨੂੰ ਮੈਪ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਸੁਤੰਤਰ ਡੇਟਾ ਪ੍ਰਾਪਤੀ (DIA) ਅਤੇ ਹੋਰ MS-ਅਧਾਰਿਤ ਰਣਨੀਤੀਆਂ ਵੀ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਤਸਦੀਕ ਲਈ ਉਪਯੋਗੀ ਹੋ ਸਕਦੀਆਂ ਹਨ। ਬਡ ਐਟ ਅਲ. (64) ਇਹ ਹਾਲ ਹੀ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ ਕਿ ਸਾਡੇ CSF ਖੋਜ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਅਤੇ ਸੁਤੰਤਰ DIA-MS ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਵਿੱਚ ਪਛਾਣੇ ਗਏ AD ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਇੱਕ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਓਵਰਲੈਪ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਤਿੰਨ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਯੂਰਪੀਅਨ ਸਮੂਹਾਂ ਦੇ ਲਗਭਗ 200 CSF ਨਮੂਨੇ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਇਹ ਤਾਜ਼ਾ ਅਧਿਐਨ ਭਰੋਸੇਯੋਗ MS-ਅਧਾਰਿਤ ਖੋਜ ਵਿੱਚ ਬਦਲਣ ਲਈ ਸਾਡੇ ਪੈਨਲਾਂ ਦੀ ਸਮਰੱਥਾ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਮੁੱਖ AD ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਹੋਰ ਵਿਕਾਸ ਲਈ ਰਵਾਇਤੀ ਐਂਟੀਬਾਡੀ ਅਤੇ ਐਪਟੈਮਰ-ਅਧਾਰਿਤ ਖੋਜ ਵੀ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ। CSF ਦੀ ਘੱਟ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੇ ਕਾਰਨ, ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ MS ਵਿਧੀਆਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਇਹਨਾਂ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦਾ ਪਤਾ ਲਗਾਉਣਾ ਵਧੇਰੇ ਮੁਸ਼ਕਲ ਹੈ। NEFL ਅਤੇ NRGN ਘੱਟ-ਭਰਪੂਰ CSF ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀਆਂ ਦੋ ਅਜਿਹੀਆਂ ਉਦਾਹਰਣਾਂ ਹਨ, ਜੋ ਸਾਡੇ ਵਿਆਪਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਮੈਪ ਕੀਤੀਆਂ ਗਈਆਂ ਹਨ, ਪਰ ਸਾਡੀ ਸਿੰਗਲ MS ਰਣਨੀਤੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਭਰੋਸੇਯੋਗ ਢੰਗ ਨਾਲ ਖੋਜਿਆ ਨਹੀਂ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਮਲਟੀਪਲ ਐਂਟੀਬਾਡੀਜ਼, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਪੀਈਏ 'ਤੇ ਆਧਾਰਿਤ ਟਾਰਗੇਟਿੰਗ ਰਣਨੀਤੀਆਂ, ਇਹਨਾਂ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਕਲੀਨਿਕਲ ਪਰਿਵਰਤਨ ਨੂੰ ਉਤਸ਼ਾਹਿਤ ਕਰ ਸਕਦੀਆਂ ਹਨ।
ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇਹ ਅਧਿਐਨ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪ੍ਰਣਾਲੀਆਂ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ CSF AD ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਅਤੇ ਤਸਦੀਕ ਲਈ ਇੱਕ ਵਿਲੱਖਣ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਪਹੁੰਚ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਵਾਧੂ AD ਸਮੂਹਾਂ ਅਤੇ MS ਪਲੇਟਫਾਰਮਾਂ ਵਿੱਚ ਇਹਨਾਂ ਮਾਰਕਰ ਪੈਨਲਾਂ ਨੂੰ ਅਨੁਕੂਲ ਬਣਾਉਣਾ AD ਜੋਖਮ ਪੱਧਰੀਕਰਨ ਅਤੇ ਇਲਾਜ ਨੂੰ ਅੱਗੇ ਵਧਾਉਣ ਦਾ ਵਾਅਦਾ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਅਧਿਐਨ ਜੋ ਸਮੇਂ ਦੇ ਨਾਲ ਇਹਨਾਂ ਪੈਨਲਾਂ ਦੇ ਲੰਬਕਾਰੀ ਪੱਧਰ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਇਹ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਨ ਲਈ ਵੀ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹਨ ਕਿ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦਾ ਕਿਹੜਾ ਸੁਮੇਲ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਜੋਖਮ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀ ਦੀ ਗੰਭੀਰਤਾ ਵਿੱਚ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਨੂੰ ਸਭ ਤੋਂ ਵਧੀਆ ਪੱਧਰੀ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ।
CSF ਦੁਆਰਾ ਨਕਲ ਕੀਤੇ 3 ਨਮੂਨਿਆਂ ਨੂੰ ਛੱਡ ਕੇ, ਇਸ ਅਧਿਐਨ ਵਿੱਚ ਵਰਤੇ ਗਏ ਸਾਰੇ CSF ਨਮੂਨੇ Emory ADRC ਜਾਂ ਨਜ਼ਦੀਕੀ ਸਬੰਧਿਤ ਖੋਜ ਸੰਸਥਾਵਾਂ ਦੀ ਸਰਪ੍ਰਸਤੀ ਹੇਠ ਇਕੱਠੇ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ। ਇਹਨਾਂ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਅਧਿਐਨਾਂ ਵਿੱਚ ਐਮਰੀ ਸੀਐਸਐਫ ਦੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੇ ਕੁੱਲ ਚਾਰ ਸੈੱਟ ਵਰਤੇ ਗਏ ਸਨ। CSF ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ 20 ਸਿਹਤਮੰਦ ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ 20 AD ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਦੇ ਨਮੂਨੇ ਪਾਏ ਗਏ ਸਨ। CSF ਕਾਪੀ 1 ਵਿੱਚ 32 ਸਿਹਤਮੰਦ ਨਿਯੰਤਰਣ, 31 AsymAD ਵਿਅਕਤੀਆਂ, ਅਤੇ 33 AD ਵਿਅਕਤੀਆਂ ਦੇ ਨਮੂਨੇ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। CSF ਕਾਪੀ 2 ਵਿੱਚ 147 ਨਿਯੰਤਰਣ ਅਤੇ 150 AD ਨਮੂਨੇ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਬਹੁ-ਰੋਗ CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ 4 ਸਮੂਹ ਵਿੱਚ 18 ਨਿਯੰਤਰਣ, 17 AD, 19 ALS, 13 PD, ਅਤੇ 11 FTD ਨਮੂਨੇ ਸ਼ਾਮਲ ਸਨ। ਐਮੋਰੀ ਯੂਨੀਵਰਸਿਟੀ ਸੰਸਥਾਗਤ ਸਮੀਖਿਆ ਬੋਰਡ ਦੁਆਰਾ ਪ੍ਰਵਾਨਿਤ ਸਮਝੌਤੇ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ, ਸਾਰੇ ਐਮੋਰੀ ਅਧਿਐਨ ਭਾਗੀਦਾਰਾਂ ਨੇ ਸੂਚਿਤ ਸਹਿਮਤੀ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੀ। ਅਲਜ਼ਾਈਮਰ ਸੈਂਟਰਾਂ ਲਈ 2014 ਦੇ ਨੈਸ਼ਨਲ ਇੰਸਟੀਚਿਊਟ ਆਫ਼ ਏਜਿੰਗ ਬੈਸਟ ਪ੍ਰੈਕਟਿਸ ਗਾਈਡਲਾਈਨਜ਼ (https://alz.washington.edu/BiospecimenTaskForce.html) ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ, ਸੀਰੀਬ੍ਰੋਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਨੂੰ ਲੰਬਰ ਪੰਕਚਰ ਦੁਆਰਾ ਇਕੱਠਾ ਕੀਤਾ ਅਤੇ ਸਟੋਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ। ਕੰਟਰੋਲ ਅਤੇ AsymAD ਅਤੇ AD ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਨੇ Emory Cognitive Neurology Clinic ਜਾਂ Goizueta ADRC ਵਿਖੇ ਮਾਨਕੀਕ੍ਰਿਤ ਬੋਧਾਤਮਕ ਮੁਲਾਂਕਣ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤਾ। ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਦਿਮਾਗੀ ਸਪਾਈਨਲ ਤਰਲ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦੀ ਜਾਂਚ INNO-BIA AlzBio3 Luminex ਦੁਆਰਾ ELISA Aβ1-42, ਕੁੱਲ ਤਾਊ ਅਤੇ ਪੀ-ਟਾਊ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ (65) ਲਈ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ। ELISA ਮੁੱਲ ਸਥਾਪਤ AD ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਕੱਟ-ਆਫ ਮਾਪਦੰਡ (66, 67) ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਵਿਸ਼ਿਆਂ ਦੇ ਡਾਇਗਨੌਸਟਿਕ ਵਰਗੀਕਰਨ ਦਾ ਸਮਰਥਨ ਕਰਨ ਲਈ ਵਰਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ। ਹੋਰ CSF ਨਿਦਾਨਾਂ (FTD, ALS, ਅਤੇ PD) ਲਈ ਮੂਲ ਜਨਸੰਖਿਆ ਅਤੇ ਡਾਇਗਨੌਸਟਿਕ ਡੇਟਾ ਵੀ Emory ADRC ਜਾਂ ਸੰਬੰਧਿਤ ਖੋਜ ਸੰਸਥਾਵਾਂ ਤੋਂ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇਹਨਾਂ Emory CSF ਕੇਸਾਂ ਲਈ ਸੰਖੇਪ ਕੇਸ ਮੈਟਾਡੇਟਾ ਸਾਰਣੀ S1A ਵਿੱਚ ਲੱਭਿਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਸਵਿਸ CSF ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ 3 ਸਮੂਹ ਦੀਆਂ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਪਹਿਲਾਂ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਕੀਤੀਆਂ ਗਈਆਂ ਹਨ (45).
CSF ਨੂੰ ਨਮੂਨਾ ਮਿਲਿਆ। ਸੀਐਸਐਫ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਦੀ ਸਾਡੀ ਖੋਜ ਦੀ ਡੂੰਘਾਈ ਨੂੰ ਵਧਾਉਣ ਲਈ, ਟ੍ਰਾਈਪਸਿਨਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ ਉੱਚ-ਭਰਪੂਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਇਮਿਊਨ ਖਪਤ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ। ਸੰਖੇਪ ਰੂਪ ਵਿੱਚ, 40 ਵਿਅਕਤੀਗਤ CSF ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚੋਂ 130 μl CSF ਅਤੇ ਇੱਕ ਬਰਾਬਰ ਵਾਲੀਅਮ (130 μl) ਉੱਚ ਚੋਣ ਵਾਲੇ ਟੌਪ 14 ਅਬਡੈਂਸ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਡਿਪਲੀਸ਼ਨ ਰੈਜ਼ਿਨ (ਥਰਮੋ ਫਿਸ਼ਰ ਸਾਇੰਟਿਫਿਕ, A36372) ਨੂੰ ਇੱਕ ਸਪਿਨ ਕਾਲਮ (ਥਰਮੋ ਫਿਸ਼ਰ ਸਾਇੰਟਿਫਿਕ, A89868) ਵਿੱਚ ਰੱਖਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਤਾਪਮਾਨ ਪ੍ਰਫੁੱਲਤ). 15 ਮਿੰਟਾਂ ਲਈ ਕਤਾਈ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ 2 ਮਿੰਟ ਲਈ 1000 ਗ੍ਰਾਮ 'ਤੇ ਸੈਂਟਰਿਫਿਊਜ ਕਰੋ। ਇੱਕ 3K ਅਲਟਰਾਸੈਂਟਰੀਫਿਊਗਲ ਫਿਲਟਰ ਯੰਤਰ (ਮਿਲੀਪੋਰ, UFC500396) ਦੀ ਵਰਤੋਂ 30 ਮਿੰਟਾਂ ਲਈ 14,000 ਗ੍ਰਾਮ 'ਤੇ ਸੈਂਟਰਿਫਿਊਗ ਕਰਕੇ ਗੰਦੇ ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ ਕੇਂਦਰਿਤ ਕਰਨ ਲਈ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ। ਫਾਸਫੇਟ ਬਫਰਡ ਖਾਰੇ ਨਾਲ ਸਾਰੇ ਨਮੂਨੇ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ 75 μl ਤੱਕ ਪਤਲਾ ਕਰੋ। ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਤਵੱਜੋ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ ਨਿਰਮਾਤਾ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੋਕੋਲ (ਥਰਮੋ ਫਿਸ਼ਰ ਸਾਇੰਟਿਫਿਕ) ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ ਬਿਕਿਨਕੋਨਿਨਿਕ ਐਸਿਡ (ਬੀਸੀਏ) ਵਿਧੀ ਦੁਆਰਾ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ। ਸਾਰੇ 40 ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚੋਂ ਇਮਯੂਨੋਡਪਲੇਟਿਡ CSF (60 μl) ਨੂੰ ਲਾਈਸਿਲ ਐਂਡੋਪੇਪਟੀਡੇਜ਼ (ਲਾਇਐਸਸੀ) ਅਤੇ ਟ੍ਰਾਈਪਸਿਨ ਨਾਲ ਹਜ਼ਮ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ। ਸੰਖੇਪ ਰੂਪ ਵਿੱਚ, ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ 1.2 μl 0.5 M ਟ੍ਰਿਸ-2 (-ਕਾਰਬੋਕਾਈਥਾਈਲ)-ਫਾਸਫਾਈਨ ਅਤੇ 3 μl 0.8 M ਕਲੋਰੋਐਸੀਟਾਮਾਈਡ ਨਾਲ 90 ° C 'ਤੇ 10 ਮਿੰਟਾਂ ਲਈ ਘਟਾ ਦਿੱਤਾ ਗਿਆ ਅਤੇ ਅਲਕਾਈਲੇਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ, ਅਤੇ ਫਿਰ 15 ਮਿੰਟਾਂ ਲਈ ਪਾਣੀ ਦੇ ਇਸ਼ਨਾਨ ਵਿੱਚ ਸੋਨਿਕ ਕੀਤਾ ਗਿਆ। ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ 193 μl 8 M ਯੂਰੀਆ ਬਫਰ [8 M ਯੂਰੀਆ ਅਤੇ 100 mM NaHPO4 (pH 8.5)] ਨਾਲ 6 M ਯੂਰੀਆ ਦੀ ਅੰਤਮ ਗਾੜ੍ਹਾਪਣ ਲਈ ਪੇਤਲਾ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ। LysC (4.5 μg; ਵਾਕੋ) ਕਮਰੇ ਦੇ ਤਾਪਮਾਨ 'ਤੇ ਰਾਤ ਭਰ ਪਾਚਨ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਫਿਰ ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ 50 ਐਮਐਮ ਅਮੋਨੀਅਮ ਬਾਈਕਾਰਬੋਨੇਟ (ਏਬੀਸੀ) (68) ਦੇ ਨਾਲ 1 ਐਮ ਯੂਰੀਆ ਵਿੱਚ ਪੇਤਲਾ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ। ਟਰਾਈਪਸਿਨ (ਪ੍ਰੋਮੇਗਾ) ਦੀ ਬਰਾਬਰ ਮਾਤਰਾ (4.5 μg) ਪਾਓ, ਅਤੇ ਫਿਰ ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ 12 ਘੰਟਿਆਂ ਲਈ ਪ੍ਰਫੁੱਲਤ ਕਰੋ। 1% ਫਾਰਮਿਕ ਐਸਿਡ (FA) ਅਤੇ 0.1% ਟ੍ਰਾਈਫਲੂਓਰੋਸੈਟਿਕ ਐਸਿਡ (TFA) (66) ਦੀ ਅੰਤਮ ਗਾੜ੍ਹਾਪਣ ਲਈ ਪਚਣ ਵਾਲੇ ਪੇਪਟਾਇਡ ਘੋਲ ਨੂੰ ਤੇਜ਼ਾਬ ਕਰੋ, ਅਤੇ ਫਿਰ ਉੱਪਰ ਦੱਸੇ ਅਨੁਸਾਰ 50 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ Sep-Pak C18 ਕਾਲਮ (ਪਾਣੀ) ਨਾਲ ਡੀਸਾਲਟ ਕਰੋ (25) . ਪੈਪਟਾਇਡ ਨੂੰ ਫਿਰ 50% ਐਸੀਟੋਨਿਟ੍ਰਾਇਲ (ACN) ਦੇ 1 ਮਿਲੀਲੀਟਰ ਵਿੱਚ ਕੱਢਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਬੈਚਾਂ (25) ਵਿੱਚ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ ਮਾਨਕੀਕਰਨ ਕਰਨ ਲਈ, ਸਾਰੇ 40 CSF ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚੋਂ 100 μl ਐਲੀਕੋਟਸ ਨੂੰ ਇੱਕ ਮਿਸ਼ਰਤ ਨਮੂਨਾ ਬਣਾਉਣ ਲਈ ਜੋੜਿਆ ਗਿਆ ਸੀ, ਜਿਸਨੂੰ ਫਿਰ ਪੰਜ ਗਲੋਬਲ ਅੰਦਰੂਨੀ ਸਟੈਂਡਰਡ (GIS) (48) ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਵੰਡਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਸਾਰੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਨਮੂਨੇ ਅਤੇ ਸੰਯੁਕਤ ਮਾਪਦੰਡ ਹਾਈ-ਸਪੀਡ ਵੈਕਿਊਮ (ਲੈਬਕੋਨਕੋ) ਦੁਆਰਾ ਸੁੱਕ ਜਾਂਦੇ ਹਨ।
CSF ਨਮੂਨੇ ਦੀ ਨਕਲ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਡੇਅਨ ਅਤੇ ਸਹਿਕਰਮੀਆਂ ਨੇ ਪਹਿਲਾਂ CSF ਕਾਪੀ 3 ਨਮੂਨੇ (45, 46) ਦੀ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧਕ ਕਮੀ ਅਤੇ ਪਾਚਨ ਦਾ ਵਰਣਨ ਕੀਤਾ ਹੈ. ਬਾਕੀ ਦੇ ਨਕਲ ਦੇ ਨਮੂਨੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਤੌਰ 'ਤੇ ਇਮਯੂਨੋਡਪਲੇਟ ਨਹੀਂ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ। ਪਹਿਲਾਂ ਦੱਸੇ ਅਨੁਸਾਰ ਟ੍ਰਿਪਸਿਨ ਵਿੱਚ ਇਹਨਾਂ ਨਾ ਹਟਾਏ ਗਏ ਨਮੂਨਿਆਂ ਨੂੰ ਡਾਇਜੈਸਟ ਕਰੋ (17)। ਹਰੇਕ ਦੁਹਰਾਏ ਗਏ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ, ਹਰੇਕ ਨਮੂਨੇ ਤੋਂ ਐਲੀਟਿਡ ਪੇਪਟਾਇਡ ਦੇ 120 μl ਐਲੀਕੋਟਸ ਨੂੰ ਇਕੱਠੇ ਪੂਲ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ ਅਤੇ ਟੀਐਮਟੀ-ਲੇਬਲ ਵਾਲੇ ਗਲੋਬਲ ਇੰਟਰਨਲ ਸਟੈਂਡਰਡ (48) ਦੇ ਤੌਰ ਤੇ ਵਰਤੇ ਜਾਣ ਲਈ ਬਰਾਬਰ ਵਾਲੀਅਮ ਐਲੀਕੋਟਸ ਵਿੱਚ ਵੰਡਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਸਾਰੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਨਮੂਨੇ ਅਤੇ ਸੰਯੁਕਤ ਮਾਪਦੰਡ ਹਾਈ-ਸਪੀਡ ਵੈਕਿਊਮ (ਲੈਬਕੋਨਕੋ) ਦੁਆਰਾ ਸੁੱਕ ਜਾਂਦੇ ਹਨ। ਘੱਟ-ਭਰਪੂਰ CSF ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਸੰਕੇਤ ਨੂੰ ਵਧਾਉਣ ਲਈ, ਹਰੇਕ ਨਮੂਨੇ ਤੋਂ 125 μl ਨੂੰ ਜੋੜ ਕੇ, ਹਰੇਕ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਤੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਇੱਕ "ਵਧਾਇਆ" ਨਮੂਨਾ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ [ਭਾਵ, ਇੱਕ ਜੈਵਿਕ ਨਮੂਨਾ ਜੋ ਖੋਜ ਨਮੂਨੇ ਦੀ ਨਕਲ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਪਰ ਉਪਲਬਧ ਮਾਤਰਾ ਹੈ। ਬਹੁਤ ਵੱਡਾ (37, 69)] ਇੱਕ ਮਿਸ਼ਰਤ CSF ਨਮੂਨੇ (17) ਵਿੱਚ ਮਿਲਾ ਦਿੱਤਾ ਗਿਆ। ਮਿਕਸਡ ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ ਫਿਰ 12 ਮਿਲੀਲੀਟਰ ਹਾਈ ਸਿਲੈਕਟ ਟੌਪ 14 ਐਬਿਊਡੈਂਸ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਰਿਮੂਵਲ ਰੈਜ਼ਿਨ (ਥਰਮੋ ਫਿਸ਼ਰ ਸਾਇੰਟਿਫਿਕ, ਏ36372) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਇਮਿਊਨੋਰਮੂਵ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ, ਜੋ ਉੱਪਰ ਦੱਸੇ ਅਨੁਸਾਰ ਹਜ਼ਮ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ, ਅਤੇ ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ ਕਈ ਟੀਐਮਟੀ ਲੇਬਲਿੰਗ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।
ਪੋਸਟ ਟਾਈਮ: ਅਗਸਤ-27-2021